61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0883 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  100 
 
 
301 aa  615  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  93.02 
 
 
319 aa  544  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  63.12 
 
 
323 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  65.27 
 
 
304 aa  341  8e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  61.07 
 
 
292 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  61 
 
 
289 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  57.19 
 
 
298 aa  335  7e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  58.06 
 
 
311 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  61.39 
 
 
285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  52.67 
 
 
319 aa  302  5.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  54.18 
 
 
295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  41.95 
 
 
472 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  41.44 
 
 
468 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  25.5 
 
 
430 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  22.78 
 
 
449 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  21.57 
 
 
600 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  21.57 
 
 
600 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.38 
 
 
568 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  26.9 
 
 
281 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  22.22 
 
 
433 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  29.11 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  31.45 
 
 
563 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
281 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  23.32 
 
 
569 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  26.32 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  23.74 
 
 
464 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3960  secreted protein  31.73 
 
 
815 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122355  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  23.89 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  23.21 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5476  hypothetical protein  27.68 
 
 
279 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.645752  normal  0.0121442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  38.67 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  23.67 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  30.39 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2777  hypothetical protein  25.42 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0200147  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  24.86 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  27.12 
 
 
526 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  26.5 
 
 
546 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  31.67 
 
 
254 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  25.76 
 
 
456 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  26.36 
 
 
456 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  28.83 
 
 
343 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  23.67 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  21.95 
 
 
607 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  21.97 
 
 
380 aa  43.1  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6616  hypothetical protein  26.9 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.187623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  28.26 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  28.57 
 
 
365 aa  43.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  25.12 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5047  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  23.76 
 
 
370 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.794338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  27.17 
 
 
324 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  30.3 
 
 
256 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  21.71 
 
 
449 aa  42.7  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  30.53 
 
 
369 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  29.17 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  29.17 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  26.43 
 
 
299 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11521  putative dienelactone hydrolase  21.03 
 
 
516 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16100  hypothetical protein  29.61 
 
 
406 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  30.53 
 
 
369 aa  42.4  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>