153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5020 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  100 
 
 
563 aa  1157    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1987  hypothetical protein  27.29 
 
 
700 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  33.33 
 
 
253 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  29.51 
 
 
417 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  29.1 
 
 
417 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2978  hypothetical protein  26.69 
 
 
777 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1229  hypothetical protein  26.84 
 
 
816 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737589  hitchhiker  0.00225369 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  32.26 
 
 
268 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1716  phospholipase/Carboxylesterase  31.94 
 
 
217 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0883  hypothetical protein  23.33 
 
 
682 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.888299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  28.76 
 
 
277 aa  101  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  29.25 
 
 
255 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5819  hypothetical protein  26.23 
 
 
816 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438939  decreased coverage  0.00192823 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0242  phospholipase/Carboxylesterase  29.91 
 
 
412 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.080802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3037  hypothetical protein  25 
 
 
850 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  32.49 
 
 
276 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0696  phospholipase/Carboxylesterase  30 
 
 
218 aa  91.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5409  phospholipase/Carboxylesterase  27.19 
 
 
468 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  28.97 
 
 
237 aa  86.7  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  27.31 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  26.52 
 
 
261 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  31.47 
 
 
249 aa  83.2  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1124  phospholipase/Carboxylesterase  27.71 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0548  phospholipase/Carboxylesterase  29.67 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0784  hypothetical protein  25.93 
 
 
752 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0799  hypothetical protein  25.93 
 
 
752 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.666809  normal  0.067283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0780  hypothetical protein  25.59 
 
 
752 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.893714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3641  phospholipase/carboxylesterase  28.14 
 
 
257 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3742  peptidase-like protein  27.91 
 
 
326 aa  77  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0822  hypothetical protein  26.72 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.390074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2160  peptidase-like protein  27.88 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.762197 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3399  phospholipase/Carboxylesterase  25 
 
 
886 aa  73.6  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0843548  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02216  phospholipase/carboxylesterase superfamily  29.95 
 
 
245 aa  72.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.195432  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  26.13 
 
 
325 aa  72  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.841468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  25.71 
 
 
365 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  28.46 
 
 
1771 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6506  phospholipase/Carboxylesterase  29.49 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0298565  normal  0.36318 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 
340 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  26.87 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0335  phospholipase/carboxylesterase  25.13 
 
 
357 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6203  phospholipase/Carboxylesterase  28.52 
 
 
292 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  25.4 
 
 
837 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1106  hypothetical protein  26.18 
 
 
355 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  27.62 
 
 
243 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0490  hypothetical protein  24.08 
 
 
357 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2287  phospholipase/Carboxylesterase  28.87 
 
 
263 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191504  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1850  putative esterase  25.27 
 
 
276 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  28.42 
 
 
316 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  35.04 
 
 
244 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  24.4 
 
 
501 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  24.76 
 
 
490 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04140  carboxylesterase  33.33 
 
 
222 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.628824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1773  phospholipase/Carboxylesterase  28.7 
 
 
239 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5584  phospholipase/carboxylesterase  24.64 
 
 
231 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.93 
 
 
666 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.346688  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0944  hypothetical protein  26.11 
 
 
265 aa  54.3  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992264  normal  0.367367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3696  peptidase-like protein  26.27 
 
 
261 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2101  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 
223 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0298  putative esterase  25.64 
 
 
286 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777822  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0613  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.27 
 
 
655 aa  52.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  25.97 
 
 
238 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  28.47 
 
 
659 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4614  phospholipase/Carboxylesterase  25.69 
 
 
238 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.376672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2781  hypothetical protein  25.85 
 
 
796 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  30.52 
 
 
326 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4839  phospholipase/Carboxylesterase  24.26 
 
 
232 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 
686 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6756  phospholipase/carboxylesterase  25.56 
 
 
225 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847027  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0696  putative esterase  27.54 
 
 
304 aa  51.6  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.665195  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2498  phospholipase/carboxylesterase  26.7 
 
 
220 aa  51.6  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1251  putative esterase  23.81 
 
 
341 aa  50.8  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4173  phospholipase/carboxylesterase  26.46 
 
 
225 aa  50.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0686  phospholipase/carboxylesterase  27.27 
 
 
232 aa  50.8  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4488  phospholipase/Carboxylesterase  26.98 
 
 
204 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4424  phospholipase/Carboxylesterase  26.98 
 
 
204 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3878  putative esterase  22.97 
 
 
560 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.71 
 
 
634 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0789  phospholipase/carboxylesterase  33.07 
 
 
206 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0528689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1148  phospholipase/Carboxylesterase  27.66 
 
 
239 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3420  phospholipase/Carboxylesterase  32.84 
 
 
205 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3813  phospholipase/carboxylesterase  26.98 
 
 
230 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0993955  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  23.68 
 
 
325 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  25.9 
 
 
298 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2641  phospholipase/carboxylesterase  29.2 
 
 
205 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.419247  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27 
 
 
279 aa  48.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  25.48 
 
 
217 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2640  hypothetical protein  28.64 
 
 
469 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.123616  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2308  putative esterase  22.26 
 
 
270 aa  47.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  36.59 
 
 
323 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1065  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.4 
 
 
667 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1603  pyrroline-5-carboxylate reductase  25 
 
 
328 aa  47.4  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1644  putative esterase  27.78 
 
 
328 aa  47.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33500  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  25.33 
 
 
429 aa  47  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00579  putative peptidase  26.2 
 
 
704 aa  47.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  31.45 
 
 
301 aa  47  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  40 
 
 
232 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0708  putative esterase  25.68 
 
 
285 aa  47  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5166  putative esterase  27.14 
 
 
295 aa  47  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  27.6 
 
 
276 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>