15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3960 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3960  secreted protein  100 
 
 		 815 aa  1573    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3950  secreted protein  35.65 
 
 		 907 aa  307  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3758  secreted protein  35.42 
 
 		 911 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4262  hypothetical protein  35.65 
 
 		 883 aa  167  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2542  hypothetical protein  28.38 
 
 		 770 aa  160  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0518  hypothetical protein  29.87 
 
 		 702 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4330  hypothetical protein  31.33 
 
 		 427 aa  115  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0043  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1808 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.06 
 
 		 2305 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.72 
 
 		 2310 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.25 
 
 		 928 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  39.13 
 
 		 2796 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  31.73 
 
 		 301 aa  45.8  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.8 
 
 		 1225 aa  44.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.65 
 
 		 647 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>