More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3001 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  100 
 
 		 2310 aa  4588    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  76.61 
 
 		 2305 aa  3462    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  51.22 
 
 		 562 aa  384  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  51.26 
 
 		 608 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  43.68 
 
 		 542 aa  285  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  41.44 
 
 		 480 aa  265  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.59 
 
 		 2194 aa  256  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  42.27 
 
 		 496 aa  244  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  34.82 
 
 		 660 aa  236  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.19 
 
 		 1340 aa  232  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 		 633 aa  224  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  37.29 
 
 		 614 aa  223  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.96 
 
 		 1225 aa  222  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  36.13 
 
 		 597 aa  222  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  37.17 
 
 		 580 aa  220  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  35.09 
 
 		 619 aa  220  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  34.63 
 
 		 649 aa  217  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  34.21 
 
 		 1414 aa  217  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  51.88 
 
 		 1037 aa  216  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.24 
 
 		 1222 aa  215  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  34.63 
 
 		 526 aa  214  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 		 658 aa  213  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  43.17 
 
 		 539 aa  204  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  43.05 
 
 		 562 aa  200  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 566 aa  197  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  31.67 
 
 		 440 aa  194  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  32.01 
 
 		 440 aa  193  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  44.37 
 
 		 507 aa  191  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.66 
 
 		 928 aa  188  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  39.44 
 
 		 451 aa  188  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  31.23 
 
 		 468 aa  184  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  38.41 
 
 		 1194 aa  183  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.24 
 
 		 891 aa  181  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  36.78 
 
 		 897 aa  180  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  31.23 
 
 		 534 aa  180  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  36.78 
 
 		 897 aa  180  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  36.78 
 
 		 897 aa  180  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  38.82 
 
 		 451 aa  179  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  39.06 
 
 		 401 aa  179  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  39.75 
 
 		 451 aa  179  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  39.75 
 
 		 451 aa  179  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  37.14 
 
 		 593 aa  179  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  36.17 
 
 		 686 aa  179  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  38.39 
 
 		 504 aa  179  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  36.17 
 
 		 686 aa  179  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  38.51 
 
 		 451 aa  178  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.92 
 
 		 1009 aa  178  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  39.38 
 
 		 453 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  39.44 
 
 		 451 aa  177  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  39.38 
 
 		 453 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  39.38 
 
 		 453 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  39.38 
 
 		 453 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  39.38 
 
 		 453 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  39.38 
 
 		 453 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.74 
 
 		 1269 aa  176  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  39.38 
 
 		 449 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  36.51 
 
 		 665 aa  176  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.78 
 
 		 1269 aa  176  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.38 
 
 		 1661 aa  175  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.75 
 
 		 1118 aa  171  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.05 
 
 		 1012 aa  167  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  36.34 
 
 		 751 aa  166  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.74 
 
 		 1113 aa  166  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  31.67 
 
 		 539 aa  165  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.06 
 
 		 768 aa  163  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 		 563 aa  161  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.3 
 
 		 889 aa  160  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  38.17 
 
 		 481 aa  160  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  40.97 
 
 		 1080 aa  157  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  38.37 
 
 		 358 aa  154  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  34.64 
 
 		 324 aa  148  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  38.93 
 
 		 426 aa  148  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  33.88 
 
 		 324 aa  145  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  39.91 
 
 		 540 aa  144  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.1 
 
 		 1800 aa  142  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 		 393 aa  142  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  34.14 
 
 		 537 aa  142  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.03 
 
 		 623 aa  140  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.62 
 
 		 1029 aa  139  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  30.53 
 
 		 5899 aa  137  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  29.6 
 
 		 1029 aa  137  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  35.71 
 
 		 315 aa  136  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  30 
 
 		 597 aa  125  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  38.59 
 
 		 584 aa  122  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  38.71 
 
 		 584 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  32.01 
 
 		 452 aa  119  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  30.61 
 
 		 552 aa  118  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  33.22 
 
 		 543 aa  117  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.03 
 
 		 526 aa  114  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  28.32 
 
 		 548 aa  113  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.57 
 
 		 1180 aa  110  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  29.89 
 
 		 465 aa  108  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  35.15 
 
 		 591 aa  107  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.2 
 
 		 3168 aa  107  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  28.29 
 
 		 514 aa  106  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  30.47 
 
 		 492 aa  105  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.61 
 
 		 1415 aa  104  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  26.97 
 
 		 642 aa  103  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  27.42 
 
 		 338 aa  100  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.88 
 
 		 255 aa  101  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>