43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2037 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  97.43 
 
 
584 aa  1151    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  100 
 
 
584 aa  1205    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  42.81 
 
 
590 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  58.54 
 
 
256 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  52.02 
 
 
231 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  49.49 
 
 
229 aa  210  7e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  48.99 
 
 
229 aa  207  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  33.33 
 
 
480 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  35.4 
 
 
496 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  34.53 
 
 
614 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  37.09 
 
 
237 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  35.85 
 
 
238 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.44 
 
 
477 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  40.88 
 
 
293 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  38.71 
 
 
562 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  45.07 
 
 
254 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  35 
 
 
608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  37.5 
 
 
2305 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  37.64 
 
 
542 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.5 
 
 
2310 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  34.22 
 
 
273 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  36.9 
 
 
337 aa  97.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  36.91 
 
 
251 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 
642 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  32.78 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 
526 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  32.95 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 
660 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  31.85 
 
 
366 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  23.12 
 
 
1414 aa  74.7  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  24.75 
 
 
597 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 
633 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  23.23 
 
 
619 aa  70.5  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  26.7 
 
 
649 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  26.11 
 
 
580 aa  63.5  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  23.27 
 
 
539 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 
658 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  22.77 
 
 
563 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  21.73 
 
 
725 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  22.12 
 
 
534 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  22.12 
 
 
468 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  22.96 
 
 
566 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  36.27 
 
 
359 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>