124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0405 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 526 aa  1087    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  64.55 
 
 		 1414 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  53.95 
 
 		 566 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  51.36 
 
 		 534 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  58.13 
 
 		 619 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  58.8 
 
 		 633 aa  529  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  49.46 
 
 		 563 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  56.58 
 
 		 597 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  57.32 
 
 		 658 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  55.56 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  54.37 
 
 		 649 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  51.82 
 
 		 580 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  44.88 
 
 		 539 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  48.17 
 
 		 660 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  36.22 
 
 		 542 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.86 
 
 		 2305 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 562 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  33.25 
 
 		 2310 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  32.26 
 
 		 608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  32 
 
 		 496 aa  159  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  28.61 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  30.85 
 
 		 614 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  25.83 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 440 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  26.03 
 
 		 725 aa  90.1  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  39.86 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  53.33 
 
 		 619 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0640  cellulosome enzyme, dockerin type I  48.89 
 
 		 582 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  47 
 
 		 707 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  27 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  59.68 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  27 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.62 
 
 		 831 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0660  glycoside hydrolase family protein  52.11 
 
 		 773 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  23.5 
 
 		 590 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  40.38 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  38.32 
 
 		 736 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 730 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  54.24 
 
 		 814 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  46.99 
 
 		 591 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  27.49 
 
 		 642 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  47.13 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  43.33 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.48 
 
 		 790 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  22.99 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  45.16 
 
 		 739 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  50.79 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  54.55 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1398  cellulosome enzyme, dockerin type I  37.3 
 
 		 842 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.461235  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  43.68 
 
 		 922 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  54.24 
 
 		 630 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  55.93 
 
 		 639 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0798  lipolytic enzyme, G-D-S-L  53.23 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  46.38 
 
 		 961 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  31.82 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  50.72 
 
 		 580 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  46.97 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  49.15 
 
 		 928 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  47.46 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  40.38 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  41.67 
 
 		 820 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  47.54 
 
 		 679 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  41.94 
 
 		 951 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 742 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  47.62 
 
 		 895 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0191  proteinase inhibitor I4, serpin  44.12 
 
 		 599 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  37.93 
 
 		 1077 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3132  cellulosome enzyme, dockerin type I  52.54 
 
 		 411 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  45 
 
 		 900 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  42.5 
 
 		 741 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0190  proteinase inhibitor I4, serpin  41.67 
 
 		 600 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.927493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  38.33 
 
 		 509 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  34.95 
 
 		 948 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  34.57 
 
 		 471 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  46.77 
 
 		 533 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  45.95 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  46.03 
 
 		 982 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  45 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  21.03 
 
 		 551 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0435  cellulosome enzyme, dockerin type I  41.67 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  44.26 
 
 		 501 aa  52.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  45 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  41.38 
 
 		 490 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0239  cellulosome enzyme, dockerin type I  45.21 
 
 		 1051 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  42.19 
 
 		 807 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  34.85 
 
 		 532 aa  50.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  21.94 
 
 		 566 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2549  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.9 
 
 		 324 aa  50.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  47.46 
 
 		 1224 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1245  pectate lyase  42.62 
 
 		 552 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 837 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  40 
 
 		 533 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  44.07 
 
 		 567 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  25.86 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  31.25 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  39.73 
 
 		 683 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  26.55 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>