135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3396 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  100 
 
 
351 aa  712    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  42.62 
 
 
238 aa  170  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  40 
 
 
237 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.93 
 
 
477 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  48.28 
 
 
293 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  34.62 
 
 
273 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  37.77 
 
 
251 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  36.78 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  38.14 
 
 
337 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  34.27 
 
 
590 aa  89.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  31.31 
 
 
366 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  54.05 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  32.95 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  32.95 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  33.87 
 
 
256 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  31.87 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.53 
 
 
639 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  39.53 
 
 
628 aa  73.9  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  30.39 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  31.87 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  36.47 
 
 
614 aa  72  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  40.85 
 
 
811 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  44.44 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  42.05 
 
 
1186 aa  66.2  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  37.33 
 
 
364 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  37.33 
 
 
491 aa  60.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  41.46 
 
 
628 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  37.14 
 
 
572 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  37.21 
 
 
934 aa  57  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  36.36 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 
1137 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  33.94 
 
 
854 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  37.35 
 
 
466 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  34.67 
 
 
925 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32.99 
 
 
609 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  38.03 
 
 
532 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  33.33 
 
 
2305 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  34.74 
 
 
846 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  39.73 
 
 
1209 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 
966 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 
621 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  37.33 
 
 
562 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  40 
 
 
1298 aa  51.6  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 
403 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  36.11 
 
 
503 aa  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  33.93 
 
 
467 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  36.47 
 
 
488 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  34.07 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  39.73 
 
 
763 aa  50.8  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  36.04 
 
 
359 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.48 
 
 
2310 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  37.5 
 
 
688 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  33.73 
 
 
623 aa  50.1  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  35.64 
 
 
468 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  35.62 
 
 
894 aa  49.7  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  35.63 
 
 
376 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  33.8 
 
 
598 aa  49.7  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  34.57 
 
 
1055 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 
580 aa  49.3  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  36.73 
 
 
389 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  33.75 
 
 
778 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00760  conserved hypothetical protein  31.48 
 
 
317 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.751145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.7 
 
 
998 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  36.62 
 
 
787 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  34.29 
 
 
436 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.72 
 
 
637 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  29.21 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  29.21 
 
 
674 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  28.97 
 
 
127 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  33.73 
 
 
842 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  26.97 
 
 
674 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  26.97 
 
 
674 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.25 
 
 
984 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  26.97 
 
 
674 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 
963 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  35.62 
 
 
842 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  26.97 
 
 
674 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  26.97 
 
 
674 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  37.5 
 
 
511 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
674 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  34.04 
 
 
851 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  40.74 
 
 
233 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  31.43 
 
 
371 aa  46.2  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  36.67 
 
 
847 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  34.29 
 
 
700 aa  46.2  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  38.36 
 
 
694 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  33.33 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  31.86 
 
 
200 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1685  peptidase S26B, signal peptidase  33.33 
 
 
638 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170419  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  33.8 
 
 
142 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  35.37 
 
 
539 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  32 
 
 
1128 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  32.95 
 
 
1007 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  34.72 
 
 
518 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  32.98 
 
 
725 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  25.84 
 
 
674 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  32.88 
 
 
938 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  34.09 
 
 
536 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  36.17 
 
 
727 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  32.91 
 
 
472 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>