108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04151 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  100 
 
 
480 aa  986    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  65.54 
 
 
496 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  64.23 
 
 
614 aa  501  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  44.22 
 
 
562 aa  279  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  42.98 
 
 
608 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  35.45 
 
 
542 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  40.88 
 
 
2305 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  40.06 
 
 
2310 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  34.39 
 
 
590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  32.95 
 
 
584 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  32.66 
 
 
584 aa  183  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 
660 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  33.6 
 
 
649 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 
526 aa  166  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  31.62 
 
 
1414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  32.43 
 
 
597 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
633 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  30.57 
 
 
619 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 
658 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  31.27 
 
 
580 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  29.43 
 
 
534 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
566 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  29.56 
 
 
468 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  31.27 
 
 
539 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 
563 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  27.97 
 
 
725 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  35.24 
 
 
632 aa  94  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  26.38 
 
 
642 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_003296  RS03897  exoglucanase A  48.15 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.216755  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3317  Protein of unknown function DUF1592  48.19 
 
 
811 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0598  cellulase  42.05 
 
 
628 aa  76.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.120048  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0553  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.05 
 
 
639 aa  75.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  24.6 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 
566 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
351 aa  67  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 
468 aa  63.9  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  38.05 
 
 
609 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  24.81 
 
 
440 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  40.91 
 
 
598 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.28 
 
 
846 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  38.24 
 
 
794 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  40 
 
 
990 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  39.53 
 
 
1186 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1882  hypothetical protein  24.63 
 
 
476 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  39.09 
 
 
812 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1893  hypothetical protein  24.26 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  29.8 
 
 
869 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2939  ATPase  39.74 
 
 
787 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
847 aa  53.5  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  41.1 
 
 
938 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  34.78 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  37.93 
 
 
744 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  41.43 
 
 
376 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.13 
 
 
767 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  42.03 
 
 
459 aa  50.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  36.62 
 
 
1055 aa  50.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  41.43 
 
 
727 aa  50.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.48 
 
 
998 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  37.14 
 
 
880 aa  49.3  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  35.63 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 
778 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  21.45 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  23.26 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 
365 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 
773 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.67 
 
 
590 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  37.33 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  41.43 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  35.63 
 
 
913 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  22.08 
 
 
900 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  38.57 
 
 
518 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  36.23 
 
 
533 aa  47  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  33.8 
 
 
596 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  34.25 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.62 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  35.14 
 
 
487 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  38.57 
 
 
688 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  36.05 
 
 
1007 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  26.75 
 
 
705 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.29 
 
 
979 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09166  cellulase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14560)  22.34 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110672  normal  0.0495135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  32.95 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  31.25 
 
 
853 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  22.92 
 
 
493 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0797  glycoside hydrolase family protein  23.26 
 
 
814 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  35.29 
 
 
694 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  36.11 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  34.67 
 
 
894 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  37.66 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  32.39 
 
 
364 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  32.88 
 
 
588 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 
966 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  36.49 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  35.29 
 
 
671 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  32.39 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  35.14 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  23.17 
 
 
545 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  25.25 
 
 
717 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  23.48 
 
 
370 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>