29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2307 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  86.02 
 
 		 238 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  54.87 
 
 		 477 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  54.12 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  45.5 
 
 		 337 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  44.22 
 
 		 351 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  38.51 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  36.79 
 
 		 584 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  37.09 
 
 		 584 aa  142  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  37.56 
 
 		 590 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  37.3 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  35.43 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  40.11 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  38.83 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  35.2 
 
 		 366 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37946  riboflavin aldehyde-forming enzyme  37.62 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.490361 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  36.54 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2872  Rare lipoprotein A  33.01 
 
 		 134 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00760  hypothetical protein  35.05 
 
 		 124 aa  52.4  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  31.03 
 
 		 454 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1256  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 109 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2949  Rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 108 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3147  Rare lipoprotein A  46.51 
 
 		 108 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000599592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  26.14 
 
 		 472 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  38.75 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00760  conserved hypothetical protein  33.01 
 
 		 317 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.751145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  38.75 
 
 		 213 aa  42  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>