14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37946 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_37946  riboflavin aldehyde-forming enzyme  100 
 
 
102 aa  212  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.490361 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02040  conserved hypothetical protein  39.32 
 
 
499 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02130  conserved hypothetical protein  40.4 
 
 
302 aa  77  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2872  Rare lipoprotein A  38.46 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  39 
 
 
359 aa  67.4  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  37.62 
 
 
237 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  34.65 
 
 
238 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.64 
 
 
477 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  36.36 
 
 
273 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  37.37 
 
 
254 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00760  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  49.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.751145  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04379  allergen Asp F7 (AFU_orthologue; AFUA_4G06670)  30.84 
 
 
284 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.738875 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00760  hypothetical protein  31.37 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  38.18 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>