29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1550 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  86.02 
 
 		 237 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  49.37 
 
 		 273 aa  228  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  53.54 
 
 		 477 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  51.98 
 
 		 293 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  54.36 
 
 		 254 aa  201  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  46.7 
 
 		 351 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  42.93 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  39.34 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  38.07 
 
 		 590 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  36.55 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  35.85 
 
 		 584 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  35.68 
 
 		 584 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  33.64 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  37.63 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  37.56 
 
 		 366 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  37.1 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  38.46 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37946  riboflavin aldehyde-forming enzyme  34.65 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.490361 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00760  hypothetical protein  35.11 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2872  Rare lipoprotein A  34 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  27.68 
 
 		 454 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1256  rare lipoprotein A  44.64 
 
 		 109 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  27.78 
 
 		 472 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  39.51 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2949  Rare lipoprotein A  45.24 
 
 		 108 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02130  conserved hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380886  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3147  Rare lipoprotein A  45.24 
 
 		 108 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000599592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  34.41 
 
 		 213 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>