23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4380 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  54.12 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  54.36 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  44.62 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  47.8 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.11 
 
 		 477 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  50 
 
 		 337 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  41.15 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  39.06 
 
 		 590 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  40.24 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  36 
 
 		 584 aa  126  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  45.07 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  37.02 
 
 		 351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  37.02 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  33 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  35.36 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  35.76 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2872  Rare lipoprotein A  37.14 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  36.73 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00760  hypothetical protein  38.1 
 
 		 124 aa  55.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37946  riboflavin aldehyde-forming enzyme  37.37 
 
 		 102 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.490361 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02130  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380886  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00760  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.751145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>