19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2872 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2872  Rare lipoprotein A  100 
 
 		 134 aa  273  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848775  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37946  riboflavin aldehyde-forming enzyme  38.46 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.490361 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02130  conserved hypothetical protein  39.39 
 
 		 302 aa  68.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0380886  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00760  conserved hypothetical protein  37.86 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.751145  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02040  conserved hypothetical protein  39.58 
 
 		 499 aa  62  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  38 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00760  hypothetical protein  33.59 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  32.65 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  34 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  37.62 
 
 		 293 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  33.01 
 
 		 237 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  34.65 
 
 		 273 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00400  B2-aldehyde-forming enzyme, putative  33.94 
 
 		 359 aa  50.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  33.58 
 
 		 251 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.650181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.71 
 
 		 477 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  44.44 
 
 		 366 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  29.25 
 
 		 351 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160784 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04379  allergen Asp F7 (AFU_orthologue; AFUA_4G06670)  34.62 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.738875 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  35.24 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>