More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1517 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  100 
 
 
127 aa  256  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  51.54 
 
 
181 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  50.39 
 
 
127 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  49.21 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
137 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
131 aa  117  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
137 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  60 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1446  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.52915  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
167 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
127 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
163 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
339 aa  107  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  38.89 
 
 
145 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4279  rare lipoprotein A  50.98 
 
 
144 aa  104  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
171 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
171 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  42.28 
 
 
261 aa  103  7e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  51.49 
 
 
199 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  50.98 
 
 
139 aa  102  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
262 aa  102  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
124 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  48.91 
 
 
122 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
370 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
358 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
133 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
360 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
360 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
163 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  56.18 
 
 
233 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
198 aa  101  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  50 
 
 
121 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
162 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  54.35 
 
 
263 aa  101  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  47.66 
 
 
186 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  48.35 
 
 
381 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
124 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
275 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
155 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
360 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
275 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
360 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
266 aa  100  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  60.53 
 
 
360 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  50 
 
 
278 aa  100  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
214 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
370 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
282 aa  99.8  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
281 aa  99.8  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
408 aa  99.4  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  51.65 
 
 
267 aa  99.4  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
322 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
120 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
238 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  42.03 
 
 
371 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  50.55 
 
 
267 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
323 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
165 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
285 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
318 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  50 
 
 
264 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
265 aa  98.2  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  55.84 
 
 
375 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  47.83 
 
 
124 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  48 
 
 
175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  50 
 
 
213 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
324 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
270 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0045  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
283 aa  98.2  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  50.55 
 
 
322 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
260 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  42.24 
 
 
221 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
249 aa  97.1  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
251 aa  97.1  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  48.39 
 
 
259 aa  97.1  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  50 
 
 
335 aa  96.7  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  50.55 
 
 
297 aa  96.7  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
260 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  49.45 
 
 
279 aa  96.3  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  50.49 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  45.65 
 
 
286 aa  95.5  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>