18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0818 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0818  putative endoglucanase protein  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2037  extracellular endoglucanase precursor  58.54 
 
 
584 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1958  rare lipoprotein A  60.96 
 
 
584 aa  291  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04177  cellulase  66.36 
 
 
590 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2115  Rare lipoprotein A  53.99 
 
 
231 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.27237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2380  Rare lipoprotein A  50.48 
 
 
229 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2092  Rare lipoprotein A  50.48 
 
 
229 aa  221  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2307  rare lipoprotein A  37.3 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1550  rare lipoprotein A  36.55 
 
 
238 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.662053  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4380  rare lipoprotein A  41.98 
 
 
254 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5557  rare lipoprotein A  43.78 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.93 
 
 
477 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4960  Rare lipoprotein A  37.7 
 
 
337 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.317885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1140  rare lipoprotein A  36.42 
 
 
273 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4611  Rare lipoprotein A  36.09 
 
 
251 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.650181 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07735  extracellular cellulase CelA/allergen Asp F7-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08030)  33.33 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3396  rare lipoprotein A  33.87 
 
 
351 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  26.79 
 
 
454 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>