181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0338 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  100 
 
 		 454 aa  915    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4285  cellulose-binding family II  49.65 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  52.53 
 
 		 702 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  47.83 
 
 		 820 aa  85.9  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  44.74 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 		 846 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  47.37 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  39.2 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  43.3 
 
 		 593 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  48.39 
 
 		 468 aa  80.5  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  43.48 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  45.83 
 
 		 673 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  44.68 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  46.32 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  47.67 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  55.29 
 
 		 545 aa  77  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  48.84 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  40 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  47.67 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  43.62 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  46.32 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  48.84 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  46.23 
 
 		 900 aa  73.2  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  42.22 
 
 		 756 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  44.79 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  48.42 
 
 		 854 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  50.6 
 
 		 655 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  44.57 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  39.86 
 
 		 694 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  43.01 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  36.61 
 
 		 681 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  41.84 
 
 		 847 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  45.74 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  43.01 
 
 		 353 aa  67  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  35.29 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  41.3 
 
 		 778 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  40.48 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 812 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  41.94 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  41.05 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  29.96 
 
 		 688 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  43.37 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  36.51 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  49.35 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  38.46 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  37.36 
 
 		 842 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 854 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  39.29 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.74 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  41.98 
 
 		 774 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  42.35 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  44.83 
 
 		 89 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  40.62 
 
 		 719 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  33.33 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  36.26 
 
 		 925 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  41.11 
 
 		 658 aa  60.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  33.64 
 
 		 773 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  43.01 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  37.11 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2166  Cellulase  42.05 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.63 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.62 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  38.61 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  37.23 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  38.27 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  38.95 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  38.89 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  43.75 
 
 		 649 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  40.96 
 
 		 1042 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  38.75 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  32.14 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  37.23 
 
 		 913 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  39.36 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  43.24 
 
 		 532 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  39.76 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  41.77 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  37.23 
 
 		 743 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  35.92 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.98 
 
 		 984 aa  57.4  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  37.23 
 
 		 656 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  35.48 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  38.04 
 
 		 596 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  42.39 
 
 		 366 aa  57  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  38.46 
 
 		 613 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  43.01 
 
 		 978 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  38.38 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  47.65 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  27.62 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  36.61 
 
 		 347 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.41 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  37.78 
 
 		 507 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  48.91 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  44.71 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  38.82 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1307  cellulose-binding family II  36.7 
 
 		 175 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.530275  hitchhiker  0.00098691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  39.36 
 
 		 997 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>