219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0316 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 368 aa  726    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  52.05 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  50.3 
 
 		 351 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  53.33 
 
 		 235 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  51.46 
 
 		 223 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  46.85 
 
 		 222 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  44.09 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  33.51 
 
 		 389 aa  152  8.999999999999999e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  31.42 
 
 		 372 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  31.4 
 
 		 354 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  31.87 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  34.41 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  29.37 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  36.44 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  31.81 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  32.72 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  35.21 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  28.61 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  30.61 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  30.61 
 
 		 389 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  32.71 
 
 		 285 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  29.06 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  33.48 
 
 		 468 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  31.07 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  31.02 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  46.67 
 
 		 820 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  32.02 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  48.25 
 
 		 702 aa  80.5  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  29.25 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  44.44 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  35.21 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  29.76 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  43.88 
 
 		 900 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  34.85 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1307  cellulose-binding family II  46.4 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.530275  hitchhiker  0.00098691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.09 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  29.17 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 534 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  46.91 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  52.63 
 
 		 854 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.11 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  47.46 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  39.86 
 
 		 756 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  51.16 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  51.76 
 
 		 545 aa  70.1  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  49.41 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  30.17 
 
 		 201 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  30.91 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  44 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  43.3 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.17 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  24.28 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  49.44 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  29.77 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 449 aa  67  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  48.28 
 
 		 673 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  45.35 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.86 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  36.81 
 
 		 846 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  50 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  23.05 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  46.46 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  47.56 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  27.93 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  27.93 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  27.93 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  47.62 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  27.93 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  45.56 
 
 		 925 aa  62.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  25.55 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  25.55 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  47.56 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  35.81 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.75 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  29.33 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  24.68 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  43.53 
 
 		 847 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.07 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  41.49 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  25.23 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.07 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.07 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  52.5 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  24.57 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  39.23 
 
 		 792 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  24.57 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  42.22 
 
 		 649 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  41.67 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  25.71 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.5 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  24.14 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  24.14 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>