More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8171 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  100 
 
 
532 aa  1063    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  66.04 
 
 
536 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  70.55 
 
 
539 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  65.03 
 
 
542 aa  666    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  68.47 
 
 
540 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  76.69 
 
 
662 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  72.63 
 
 
651 aa  574  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  68.38 
 
 
540 aa  526  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  69.65 
 
 
792 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  51.9 
 
 
521 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  49.76 
 
 
703 aa  346  8e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  34.8 
 
 
559 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  39.81 
 
 
652 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  40.64 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  36.21 
 
 
1271 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.19 
 
 
762 aa  217  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  36.41 
 
 
425 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  34.24 
 
 
400 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  37.9 
 
 
455 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  36.16 
 
 
414 aa  200  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  36.7 
 
 
854 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  34.24 
 
 
763 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.99 
 
 
869 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  30.52 
 
 
439 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  32.92 
 
 
451 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  31.6 
 
 
855 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.67 
 
 
868 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 
868 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  28.75 
 
 
868 aa  180  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.09 
 
 
868 aa  179  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  30.91 
 
 
563 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  31.6 
 
 
848 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 
868 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  29.6 
 
 
868 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
484 aa  173  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  30.54 
 
 
848 aa  174  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  29.17 
 
 
867 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  32.87 
 
 
586 aa  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 
472 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 
863 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.61 
 
 
1080 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.79 
 
 
674 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.79 
 
 
674 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.96 
 
 
674 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.01 
 
 
674 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.57 
 
 
674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.57 
 
 
674 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.57 
 
 
674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 
674 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  35.34 
 
 
398 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  31.74 
 
 
674 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  31.33 
 
 
674 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  32.51 
 
 
652 aa  161  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  32.29 
 
 
674 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  30.33 
 
 
972 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  31.29 
 
 
675 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  30.67 
 
 
482 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  33.42 
 
 
505 aa  143  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  32.17 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.14 
 
 
639 aa  140  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.83 
 
 
463 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  57.6 
 
 
613 aa  134  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.17 
 
 
372 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  29.27 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  28.87 
 
 
431 aa  125  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  30.53 
 
 
1578 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.99 
 
 
388 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  31.07 
 
 
401 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  27.05 
 
 
657 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  29.18 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  27.09 
 
 
499 aa  113  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  31.94 
 
 
997 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.57 
 
 
1362 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  29.58 
 
 
377 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  48.97 
 
 
552 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  28.21 
 
 
366 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  45.31 
 
 
468 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  29.88 
 
 
1146 aa  101  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  52.04 
 
 
462 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 
465 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 
1127 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  49.52 
 
 
514 aa  98.2  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  29.73 
 
 
1127 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  29.73 
 
 
1127 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  49.48 
 
 
459 aa  97.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  29.81 
 
 
861 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  29.73 
 
 
1127 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  44.19 
 
 
467 aa  95.1  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 
904 aa  94  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  28.12 
 
 
772 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.11 
 
 
1132 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  26.89 
 
 
634 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 
1129 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.57 
 
 
382 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 
364 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  46.49 
 
 
2310 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  29.58 
 
 
1053 aa  90.9  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  29.25 
 
 
855 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  28.45 
 
 
1054 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  28.74 
 
 
1051 aa  88.6  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>