203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3196 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  100 
 
 
861 aa  1762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  49.41 
 
 
699 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  48.65 
 
 
699 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  48.65 
 
 
699 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  48.65 
 
 
699 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  48.65 
 
 
699 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.31 
 
 
868 aa  221  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  28.14 
 
 
869 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  28.11 
 
 
972 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  28.18 
 
 
868 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 
868 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  29.4 
 
 
868 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  28.77 
 
 
867 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  28.12 
 
 
868 aa  210  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  29.25 
 
 
868 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  32.39 
 
 
1271 aa  203  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  28.11 
 
 
848 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 
863 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.36 
 
 
855 aa  192  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.73 
 
 
848 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.23 
 
 
674 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.23 
 
 
674 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.23 
 
 
674 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.14 
 
 
674 aa  147  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 
674 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.14 
 
 
674 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.14 
 
 
674 aa  146  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.14 
 
 
674 aa  144  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.51 
 
 
674 aa  144  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  33.64 
 
 
521 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  27.73 
 
 
674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  28.28 
 
 
674 aa  142  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  28.57 
 
 
563 aa  141  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  30.85 
 
 
414 aa  135  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  29.54 
 
 
439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 
652 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  32.14 
 
 
377 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  34.19 
 
 
373 aa  129  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  30.19 
 
 
1080 aa  129  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 
364 aa  129  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  30.33 
 
 
431 aa  129  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 
465 aa  127  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  29.31 
 
 
703 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  29.89 
 
 
451 aa  124  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 
1782 aa  124  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  26.53 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  29.19 
 
 
482 aa  121  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  26.14 
 
 
762 aa  121  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  27.58 
 
 
652 aa  121  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  29.23 
 
 
854 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  26.97 
 
 
639 aa  117  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.28 
 
 
388 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  30 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  26.28 
 
 
1362 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  28.42 
 
 
505 aa  111  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.88 
 
 
382 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 
484 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  31.29 
 
 
792 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  27.56 
 
 
763 aa  108  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.73 
 
 
455 aa  107  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  27.76 
 
 
559 aa  106  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  27.27 
 
 
425 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.77 
 
 
675 aa  104  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  29.19 
 
 
401 aa  103  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  31.38 
 
 
539 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  26.4 
 
 
662 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 
1578 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  28.05 
 
 
563 aa  99.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 
1598 aa  98.6  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  30.28 
 
 
540 aa  98.2  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  25.62 
 
 
400 aa  97.4  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  24.94 
 
 
398 aa  97.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  25.48 
 
 
372 aa  97.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  27.44 
 
 
355 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  27.6 
 
 
472 aa  96.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  29.38 
 
 
536 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  27.91 
 
 
396 aa  95.5  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 
540 aa  94.4  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  27.52 
 
 
827 aa  94.4  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  26.69 
 
 
1132 aa  93.2  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  31.09 
 
 
542 aa  93.2  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.05 
 
 
463 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  29.81 
 
 
532 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  27.36 
 
 
499 aa  89.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  29.01 
 
 
600 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  29.04 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  24.56 
 
 
1246 aa  85.5  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  25.56 
 
 
1443 aa  85.1  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  21.45 
 
 
634 aa  82.4  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
426 aa  82  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  35.23 
 
 
833 aa  80.9  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.73 
 
 
657 aa  80.5  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  33.33 
 
 
765 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  24.21 
 
 
407 aa  79  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  24.19 
 
 
651 aa  74.3  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  29.12 
 
 
1011 aa  72  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 
1776 aa  70.1  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0516109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  23.72 
 
 
855 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  21.96 
 
 
1129 aa  64.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  38.12 
 
 
999 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>