120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6135 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 
455 aa  929    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  44.32 
 
 
472 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  43.78 
 
 
652 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  42.07 
 
 
559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  43.8 
 
 
414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  41.4 
 
 
425 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  43.35 
 
 
430 aa  296  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  38.8 
 
 
521 aa  283  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  41.51 
 
 
763 aa  276  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  38.48 
 
 
675 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  41.02 
 
 
400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  39.34 
 
 
854 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  39.59 
 
 
762 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 
703 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  37.86 
 
 
451 aa  250  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  35.24 
 
 
439 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  33.63 
 
 
674 aa  216  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  33.11 
 
 
674 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  33.63 
 
 
586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.89 
 
 
674 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  33.11 
 
 
674 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  33.11 
 
 
674 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  33.11 
 
 
674 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  33.11 
 
 
674 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  34.39 
 
 
674 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  33.71 
 
 
674 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  33.26 
 
 
674 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  36.11 
 
 
484 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.51 
 
 
674 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  35.84 
 
 
536 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  36.34 
 
 
651 aa  200  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  37.65 
 
 
532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  35.32 
 
 
539 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  35.56 
 
 
662 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.92 
 
 
482 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 
540 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  33.75 
 
 
542 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  33.98 
 
 
540 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  34.25 
 
 
792 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 
652 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  32.69 
 
 
398 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  32.69 
 
 
377 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  30.79 
 
 
639 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  33.41 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  31.27 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.29 
 
 
372 aa  156  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  29.8 
 
 
868 aa  156  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  30.3 
 
 
463 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  29.43 
 
 
1271 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  29.98 
 
 
868 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.5 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  29.98 
 
 
869 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  30.65 
 
 
373 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  28.67 
 
 
868 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  29.16 
 
 
867 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 
863 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  34.53 
 
 
401 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
868 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  28.7 
 
 
868 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  28.5 
 
 
407 aa  143  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.15 
 
 
868 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  31.61 
 
 
355 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  26.28 
 
 
657 aa  133  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  26.95 
 
 
848 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  27.48 
 
 
563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  29.38 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  25.28 
 
 
1080 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  27.13 
 
 
972 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  30.95 
 
 
634 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  28.27 
 
 
760 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.03 
 
 
848 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  29.46 
 
 
699 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  29.46 
 
 
699 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  29.46 
 
 
699 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.41 
 
 
366 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  27.66 
 
 
1127 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  26.8 
 
 
855 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  27.66 
 
 
1127 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  29.13 
 
 
699 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  28.94 
 
 
699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  27.66 
 
 
1127 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  27.79 
 
 
431 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.21 
 
 
861 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.89 
 
 
499 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 
1127 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.58 
 
 
1578 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 
1129 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  23.16 
 
 
855 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.96 
 
 
1146 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
1782 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 
904 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  26.72 
 
 
1054 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  26.22 
 
 
1053 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  23.02 
 
 
1246 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  27.73 
 
 
997 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  26.41 
 
 
1051 aa  99.8  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 
465 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  23.72 
 
 
1132 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  27.62 
 
 
563 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 
1443 aa  94.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>