231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1381 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  100 
 
 
651 aa  1327    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  72.63 
 
 
532 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  72.43 
 
 
539 aa  552  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  70.54 
 
 
540 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  69.92 
 
 
662 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  68.01 
 
 
542 aa  525  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  67.11 
 
 
536 aa  521  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  66.85 
 
 
792 aa  511  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  65.05 
 
 
540 aa  510  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  51.95 
 
 
521 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  46.73 
 
 
703 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  41.89 
 
 
430 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  39.26 
 
 
652 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  35.78 
 
 
1271 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.26 
 
 
762 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  36.68 
 
 
559 aa  208  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  36.09 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  34.92 
 
 
400 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  34.07 
 
 
439 aa  194  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  35.08 
 
 
854 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  36.34 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  34.17 
 
 
414 aa  186  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  34.32 
 
 
586 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  34.47 
 
 
451 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  47.62 
 
 
313 aa  170  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  32.07 
 
 
763 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  31.72 
 
 
868 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  32.45 
 
 
868 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  46.19 
 
 
356 aa  167  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  31.89 
 
 
868 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 
868 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  30.6 
 
 
869 aa  165  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  34.06 
 
 
472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  30.82 
 
 
863 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.33 
 
 
639 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  31.89 
 
 
868 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  50 
 
 
338 aa  163  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.11 
 
 
674 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  40.08 
 
 
266 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  32.89 
 
 
482 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.88 
 
 
674 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.88 
 
 
674 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.65 
 
 
674 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  31.18 
 
 
867 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  35.14 
 
 
398 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.04 
 
 
868 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  49.44 
 
 
266 aa  160  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  50.68 
 
 
245 aa  160  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  31.72 
 
 
674 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.13 
 
 
674 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 
484 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.72 
 
 
674 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  32.78 
 
 
563 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  31.67 
 
 
674 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  39.2 
 
 
262 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  31.59 
 
 
674 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 
674 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  29.73 
 
 
855 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  47.67 
 
 
244 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  45.98 
 
 
172 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.14 
 
 
674 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.46 
 
 
848 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  50.68 
 
 
251 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  32.6 
 
 
463 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  44.71 
 
 
171 aa  150  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  48.72 
 
 
183 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  28.18 
 
 
675 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  29.02 
 
 
972 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  29.08 
 
 
848 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  31.65 
 
 
431 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  30.33 
 
 
1080 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  31.58 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
652 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.31 
 
 
372 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  40.2 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  29.19 
 
 
373 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 
1578 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  39.49 
 
 
197 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  30.24 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  29.35 
 
 
407 aa  111  5e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  36.76 
 
 
201 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  26.61 
 
 
388 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  29.61 
 
 
366 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  104  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  36.27 
 
 
455 aa  105  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  36.27 
 
 
455 aa  104  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  36.27 
 
 
455 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  25.59 
 
 
499 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  35.78 
 
 
455 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  35.78 
 
 
455 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  37.38 
 
 
458 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  36.27 
 
 
455 aa  102  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  35.78 
 
 
455 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  35.78 
 
 
455 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  35.78 
 
 
455 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  35.78 
 
 
455 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  30.25 
 
 
401 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  25.56 
 
 
657 aa  100  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  35.64 
 
 
456 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.49 
 
 
459 aa  97.8  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>