104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1483 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  57.86 
 
 
338 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  66.53 
 
 
245 aa  298  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  51.85 
 
 
356 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  58.71 
 
 
266 aa  281  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  55.02 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  53.16 
 
 
262 aa  265  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  58.8 
 
 
251 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  61.27 
 
 
171 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  63.95 
 
 
172 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  58.55 
 
 
183 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  41.41 
 
 
651 aa  161  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  44.95 
 
 
201 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  43.98 
 
 
197 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  45.11 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  39.88 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.41 
 
 
481 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.41 
 
 
481 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.41 
 
 
481 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  35.66 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.41 
 
 
481 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  32.08 
 
 
459 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  35.9 
 
 
221 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  35.9 
 
 
221 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.65 
 
 
477 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  34.87 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  34.87 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  34.87 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  34.87 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  34.87 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.53 
 
 
491 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  34.87 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  34.87 
 
 
221 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  35.9 
 
 
221 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
458 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.16 
 
 
481 aa  99  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.03 
 
 
491 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.83 
 
 
491 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  35.9 
 
 
197 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  31.68 
 
 
456 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  34.95 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.16 
 
 
471 aa  95.5  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  28.85 
 
 
307 aa  95.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  37.31 
 
 
455 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.36 
 
 
473 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.87 
 
 
456 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  34.5 
 
 
455 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.57 
 
 
455 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.02 
 
 
455 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
455 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  34 
 
 
455 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  34 
 
 
455 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  34.04 
 
 
455 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  34.04 
 
 
455 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  31.63 
 
 
455 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  33.89 
 
 
458 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  31.63 
 
 
455 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  30.43 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.38 
 
 
487 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.95 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  35.56 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.29 
 
 
491 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.67 
 
 
485 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  33.16 
 
 
445 aa  77  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  62.75 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  64.44 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  68.18 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  48.61 
 
 
904 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.63 
 
 
497 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  65.91 
 
 
790 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  58.14 
 
 
551 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  65.79 
 
 
1077 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  27.51 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.53 
 
 
477 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  28.17 
 
 
390 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  29.53 
 
 
393 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  45.71 
 
 
543 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  57.14 
 
 
652 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  58.54 
 
 
561 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  51.11 
 
 
855 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  59.52 
 
 
492 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  42.03 
 
 
484 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  31.93 
 
 
192 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  28.87 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  26.15 
 
 
391 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  46.51 
 
 
598 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  25.12 
 
 
464 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  48.72 
 
 
521 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  27.83 
 
 
214 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  27.83 
 
 
214 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  27.83 
 
 
214 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  27.83 
 
 
233 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  27.83 
 
 
214 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  27.83 
 
 
233 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  27.73 
 
 
388 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  27.83 
 
 
185 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.17 
 
 
465 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  34.83 
 
 
483 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  27.83 
 
 
214 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  34.83 
 
 
483 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>