145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_34870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_34870  chitinase  100 
 
 		 483 aa  991    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  95.45 
 
 		 483 aa  948    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  66.53 
 
 		 484 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  76.95 
 
 		 353 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  55.7 
 
 		 803 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  55.68 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  51.09 
 
 		 471 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  51.09 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  46.3 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  53.43 
 
 		 699 aa  359  6e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  53.03 
 
 		 565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  53.99 
 
 		 727 aa  356  5e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  51.6 
 
 		 729 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  51.6 
 
 		 729 aa  355  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  36.6 
 
 		 1113 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.25 
 
 		 1362 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  28.65 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  28.65 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  28.65 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  28.36 
 
 		 360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  29.07 
 
 		 360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  28.65 
 
 		 360 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  28.49 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  30.09 
 
 		 846 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  28.36 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.53 
 
 		 846 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  28.06 
 
 		 420 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  26.65 
 
 		 848 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.13 
 
 		 510 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  27.96 
 
 		 846 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  30.25 
 
 		 341 aa  96.7  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.56 
 
 		 648 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 		 551 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  25.38 
 
 		 543 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 1578 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  27.44 
 
 		 468 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  26.76 
 
 		 680 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  25.65 
 
 		 376 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  30.86 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.87 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  24.53 
 
 		 613 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  27.72 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  36.11 
 
 		 685 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  36.11 
 
 		 685 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  36.11 
 
 		 685 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  33.11 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  32.14 
 
 		 749 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  30.61 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  30.61 
 
 		 456 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  31.25 
 
 		 787 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  32.14 
 
 		 660 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  33.87 
 
 		 189 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  28.08 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.14 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.77 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  33.54 
 
 		 743 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.5 
 
 		 465 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.77 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  29.45 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  28.77 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.59 
 
 		 1209 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  43.59 
 
 		 1137 aa  66.6  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.77 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.77 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.08 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.08 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40.51 
 
 		 1121 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  46.15 
 
 		 1298 aa  60.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.9 
 
 		 6885 aa  60.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.78 
 
 		 809 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.08 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1740  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.08 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.548806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1342  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.08 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.968046  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0529  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.08 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.08 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.08 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0624  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  39.08 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.520528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  26.87 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  38.64 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  29.25 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  37.8 
 
 		 973 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  32.17 
 
 		 655 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.27 
 
 		 703 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  37.36 
 
 		 1887 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  26.01 
 
 		 582 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  33.91 
 
 		 2170 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  39.73 
 
 		 649 aa  54.3  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  32.32 
 
 		 235 aa  53.5  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  28.57 
 
 		 1154 aa  53.5  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  37.21 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  36.17 
 
 		 900 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  36.36 
 
 		 608 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  52.38 
 
 		 277 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>