167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1223 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_34870  chitinase  66.53 
 
 		 483 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  67.73 
 
 		 483 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 484 aa  990    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  71.67 
 
 		 353 aa  521  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  54.08 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  53.7 
 
 		 598 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  57.08 
 
 		 803 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  53.66 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  49.24 
 
 		 492 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  56.12 
 
 		 729 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  56.12 
 
 		 729 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  56.1 
 
 		 699 aa  364  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  55.06 
 
 		 727 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  54.6 
 
 		 565 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  37.58 
 
 		 1113 aa  180  5.999999999999999e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  27.53 
 
 		 1362 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  27.19 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  27.19 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  27.19 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.2 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  26.9 
 
 		 360 aa  106  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  27.09 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  26.88 
 
 		 543 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  26.92 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  27.09 
 
 		 360 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  25.76 
 
 		 846 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  26.05 
 
 		 846 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.01 
 
 		 648 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  26.9 
 
 		 360 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  25.77 
 
 		 848 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 1578 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  27.78 
 
 		 420 aa  96.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 551 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  39.58 
 
 		 685 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  39.58 
 
 		 685 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  39.58 
 
 		 685 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  25.73 
 
 		 846 aa  94  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  30 
 
 		 468 aa  89.7  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  28.8 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  27.86 
 
 		 613 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  25.34 
 
 		 680 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  27.97 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  29.75 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  26 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  33.1 
 
 		 787 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.16 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  31.72 
 
 		 749 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.45 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  31.94 
 
 		 660 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  32.47 
 
 		 465 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  30.5 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  31.39 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.13 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  35.14 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  45.26 
 
 		 900 aa  68.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  32.21 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  31.54 
 
 		 456 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  34.46 
 
 		 1209 aa  66.6  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  41.82 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  31.54 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  43.21 
 
 		 1121 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  30.67 
 
 		 458 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  46.91 
 
 		 973 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.77 
 
 		 2170 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  26.17 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  41.98 
 
 		 1137 aa  63.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  39.13 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  39.13 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  36.04 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  36.94 
 
 		 455 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40.62 
 
 		 743 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  38.04 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  38.04 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  38.04 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.04 
 
 		 6885 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  43.12 
 
 		 1007 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  36.56 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  39.56 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  40.35 
 
 		 938 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  35.87 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.84 
 
 		 809 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  41.11 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  58.14 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  41.76 
 
 		 1160 aa  57.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  54.55 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  41.24 
 
 		 543 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.78 
 
 		 762 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  37.78 
 
 		 614 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.82 
 
 		 795 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  30.67 
 
 		 523 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  20.85 
 
 		 582 aa  54.3  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.28 
 
 		 271 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  41.86 
 
 		 492 aa  53.9  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  36.47 
 
 		 1154 aa  53.5  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  42.03 
 
 		 1298 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  40.4 
 
 		 1887 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.22 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1570  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase precursor  40.22 
 
 		 492 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>