213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0692 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  89.66 
 
 		 464 aa  845    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 465 aa  958    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  35.23 
 
 		 455 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  35.23 
 
 		 455 aa  223  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  35 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.77 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  34.77 
 
 		 455 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  34.77 
 
 		 455 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  35.15 
 
 		 456 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  34.55 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  35.08 
 
 		 445 aa  217  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  34.32 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.86 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.55 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  35 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  34.69 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  49.06 
 
 		 233 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  49.76 
 
 		 233 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  48.58 
 
 		 214 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  49.76 
 
 		 214 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  49.76 
 
 		 214 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  49.76 
 
 		 214 aa  206  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  49.76 
 
 		 214 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.11 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  52.85 
 
 		 192 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  46.97 
 
 		 211 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  50 
 
 		 185 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  48.97 
 
 		 236 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  43.79 
 
 		 685 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  43.79 
 
 		 685 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  43.79 
 
 		 685 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.86 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  32.26 
 
 		 598 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.27 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  35.68 
 
 		 221 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.76 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  36 
 
 		 216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.63 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.24 
 
 		 491 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  35.68 
 
 		 221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  35.68 
 
 		 221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  35.68 
 
 		 221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  35.68 
 
 		 221 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  35.18 
 
 		 221 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.31 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  35.18 
 
 		 221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.31 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  34.95 
 
 		 221 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.31 
 
 		 481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.31 
 
 		 481 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  35.18 
 
 		 221 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  35.55 
 
 		 220 aa  109  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  34.67 
 
 		 221 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 211 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.27 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.12 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.36 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.82 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  35.16 
 
 		 762 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  37.99 
 
 		 487 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  33.91 
 
 		 2170 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.35 
 
 		 6885 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 197 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.79 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  32 
 
 		 201 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  36.07 
 
 		 743 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  30.36 
 
 		 803 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  31.98 
 
 		 201 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 247 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.19 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  27.87 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.34 
 
 		 497 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  33.68 
 
 		 854 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.52 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  31.58 
 
 		 973 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  34.93 
 
 		 703 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  34.19 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  36.17 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  31.76 
 
 		 1004 aa  76.6  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  31.96 
 
 		 1221 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  30.85 
 
 		 197 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  32.41 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  32.43 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  35.4 
 
 		 1462 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  31.25 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  30.57 
 
 		 768 aa  73.6  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  33.09 
 
 		 749 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  31.61 
 
 		 1050 aa  73.2  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  33.17 
 
 		 1887 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  28.49 
 
 		 787 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.9 
 
 		 729 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  31.91 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  27.1 
 
 		 680 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 1209 aa  70.5  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.61 
 
 		 1628 aa  70.1  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 1137 aa  70.1  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  25.74 
 
 		 2334 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  30.73 
 
 		 1160 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>