90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3979 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  100 
 
 		 233 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  99.53 
 
 		 233 aa  443  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  95.33 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  99.46 
 
 		 185 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  51.21 
 
 		 464 aa  207  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  49.76 
 
 		 465 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  46.95 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  50.76 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  49.75 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  38.94 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  38.42 
 
 		 455 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  38.73 
 
 		 455 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  38.73 
 
 		 455 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  38.73 
 
 		 455 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  38.42 
 
 		 455 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  38.42 
 
 		 455 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 459 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  36.73 
 
 		 456 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  37.93 
 
 		 455 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.02 
 
 		 491 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  37.44 
 
 		 455 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  37.93 
 
 		 455 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  37.93 
 
 		 455 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  32.5 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  36.22 
 
 		 456 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.47 
 
 		 477 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 458 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  32.34 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.3 
 
 		 471 aa  101  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 455 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.09 
 
 		 491 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  32.34 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  36.54 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  35 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.02 
 
 		 491 aa  98.6  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  32 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  31.84 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  32.84 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  31.34 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  31.34 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  31.34 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  31.34 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  31.34 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  31.34 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  39.19 
 
 		 487 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.03 
 
 		 491 aa  92.8  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.5 
 
 		 473 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  36.51 
 
 		 458 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.37 
 
 		 481 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.37 
 
 		 481 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.37 
 
 		 481 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.37 
 
 		 481 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  38.3 
 
 		 445 aa  89  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.59 
 
 		 487 aa  88.6  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.21 
 
 		 481 aa  87.8  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.07 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  30.24 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  29.51 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.71 
 
 		 485 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.58 
 
 		 497 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  28.67 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  27.66 
 
 		 389 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  27.66 
 
 		 388 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  25.12 
 
 		 429 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  27.4 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  23.44 
 
 		 347 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  24.26 
 
 		 390 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  28.18 
 
 		 172 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  23.67 
 
 		 438 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  29.58 
 
 		 400 aa  48.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  25.53 
 
 		 391 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  27.52 
 
 		 356 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  26.02 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  26.43 
 
 		 307 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  27.83 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  24.07 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  22.61 
 
 		 338 aa  45.1  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  26.57 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  24.46 
 
 		 378 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  24.59 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  51.43 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  26.43 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 266 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>