89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2456 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  96.24 
 
 		 266 aa  497  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  52.53 
 
 		 356 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  53 
 
 		 338 aa  278  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  52.47 
 
 		 262 aa  258  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  55.51 
 
 		 244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  51.59 
 
 		 245 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  52.69 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  57.83 
 
 		 171 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  55.26 
 
 		 172 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  52.98 
 
 		 183 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  40.08 
 
 		 651 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  39.39 
 
 		 313 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  42.25 
 
 		 201 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  39.77 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  39.09 
 
 		 197 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.32 
 
 		 491 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.29 
 
 		 477 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  39.34 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  39.78 
 
 		 221 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  39.78 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  39.78 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  39.78 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  39.78 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  39.78 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  39.78 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  39.78 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.78 
 
 		 473 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.83 
 
 		 491 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.75 
 
 		 486 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  36.81 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.95 
 
 		 491 aa  99.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 455 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.36 
 
 		 481 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.36 
 
 		 481 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.36 
 
 		 481 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  31.88 
 
 		 456 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 197 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  32.61 
 
 		 455 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.64 
 
 		 455 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  33.99 
 
 		 455 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  34.11 
 
 		 455 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.33 
 
 		 455 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.18 
 
 		 455 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.24 
 
 		 455 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.18 
 
 		 455 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33 
 
 		 456 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.71 
 
 		 481 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.25 
 
 		 491 aa  93.2  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 458 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  32.24 
 
 		 455 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  32.24 
 
 		 455 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.2 
 
 		 471 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 459 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  31.68 
 
 		 445 aa  85.5  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  28.11 
 
 		 220 aa  85.1  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.94 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.07 
 
 		 458 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.81 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  32.22 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.47 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  27.27 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.87 
 
 		 497 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  27.99 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  28.29 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  27.5 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  27 
 
 		 464 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  42.7 
 
 		 477 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 904 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  55.56 
 
 		 790 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  52.78 
 
 		 551 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  25.98 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  27.24 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.27 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  37.63 
 
 		 484 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  57.78 
 
 		 855 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  26.18 
 
 		 400 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  48.84 
 
 		 652 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  39.24 
 
 		 483 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 192 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  35.23 
 
 		 543 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  25 
 
 		 390 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  38.75 
 
 		 483 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.94 
 
 		 457 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  52.27 
 
 		 492 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  42.86 
 
 		 598 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  47.62 
 
 		 561 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>