44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2193 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  100 
 
 		 790 aa  1593    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2831  hypothetical protein  42.31 
 
 		 535 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776559  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2687  hypothetical protein  31.5 
 
 		 508 aa  235  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2787  hypothetical protein  35.68 
 
 		 1037 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.595004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2150  hypothetical protein  33.68 
 
 		 1043 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1803  hypothetical protein  33.89 
 
 		 1030 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000714199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4090  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1061 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.872685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1840  hypothetical protein  31.33 
 
 		 538 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000982396 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3726  hypothetical protein  32.62 
 
 		 997 aa  177  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.036218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  42.95 
 
 		 524 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  43.17 
 
 		 518 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2692  hypothetical protein  24.8 
 
 		 503 aa  90.5  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.996294  decreased coverage  0.00255233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  45.13 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  59.32 
 
 		 561 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3862  hypothetical protein  23.14 
 
 		 582 aa  70.5  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00590592  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 551 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  56.82 
 
 		 262 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  63.64 
 
 		 245 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  62.79 
 
 		 904 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  65.91 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.09 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  56.82 
 
 		 271 aa  63.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  59.52 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  54.55 
 
 		 285 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  54.55 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  59.52 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  55.56 
 
 		 855 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  60.53 
 
 		 1077 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  60.47 
 
 		 543 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  50.85 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  50.91 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  52.27 
 
 		 652 aa  55.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  50 
 
 		 307 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3182  hypothetical protein  27.7 
 
 		 582 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  55.56 
 
 		 266 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  55.56 
 
 		 266 aa  52  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  63.64 
 
 		 251 aa  51.2  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4192  hypothetical protein  21.97 
 
 		 544 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.667797  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  64.86 
 
 		 431 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3516  hypothetical protein  30 
 
 		 691 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.716202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 484 aa  48.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1079  hypothetical protein  27.9 
 
 		 582 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  47.62 
 
 		 483 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  47.62 
 
 		 483 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>