152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1022 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 492 aa  998    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  75.26 
 
 		 561 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  68.23 
 
 		 514 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  52.91 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  59.66 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  42.96 
 
 		 591 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  41.02 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.58 
 
 		 526 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  32.8 
 
 		 562 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  30.3 
 
 		 751 aa  143  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  32.57 
 
 		 597 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  31.8 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  31.19 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.75 
 
 		 623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  30.99 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  31.58 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  31.52 
 
 		 1194 aa  125  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  32.44 
 
 		 315 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  32.03 
 
 		 453 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  30.77 
 
 		 593 aa  123  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  31.47 
 
 		 507 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  31.49 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  30.38 
 
 		 665 aa  122  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  30.99 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  30.99 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  31.1 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  30.63 
 
 		 451 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  31.69 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  31.69 
 
 		 451 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  31.32 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  29.8 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  28.52 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  38.79 
 
 		 613 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  28.81 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  26.9 
 
 		 2305 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  29.15 
 
 		 465 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  29.52 
 
 		 2310 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  25.06 
 
 		 548 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  29.68 
 
 		 537 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  29.37 
 
 		 543 aa  93.6  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  26.07 
 
 		 324 aa  93.2  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  26.43 
 
 		 324 aa  93.2  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  26.76 
 
 		 686 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  26.76 
 
 		 686 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  26.41 
 
 		 897 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  26.41 
 
 		 897 aa  87  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  26.41 
 
 		 897 aa  87  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  24.75 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  25.67 
 
 		 481 aa  84.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  27.72 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  66.67 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  38.81 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  38.98 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  32.76 
 
 		 680 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  26.4 
 
 		 671 aa  67  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  48.39 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  66.67 
 
 		 904 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  25.32 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  29.35 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  59.18 
 
 		 855 aa  63.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  61.36 
 
 		 245 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  24.24 
 
 		 521 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  65.79 
 
 		 1077 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  28.77 
 
 		 847 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  43.75 
 
 		 743 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  47.5 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  63.04 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  32.04 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  59.09 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  38.53 
 
 		 1154 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  28.75 
 
 		 703 aa  58.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  57.89 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  44.05 
 
 		 2170 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.61 
 
 		 762 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  45.21 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  57.14 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 		 652 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 658 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  50.85 
 
 		 338 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  47.95 
 
 		 973 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  43.21 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  48.08 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.76 
 
 		 271 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  56.82 
 
 		 244 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  40.45 
 
 		 649 aa  53.9  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  71.43 
 
 		 251 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.62 
 
 		 809 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  35.83 
 
 		 614 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  38.79 
 
 		 938 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  46.81 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  45.68 
 
 		 1121 aa  51.2  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  34.44 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  58.33 
 
 		 543 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>