112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1632 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 
338 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  84.59 
 
 
356 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  54.96 
 
 
266 aa  289  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  54.09 
 
 
266 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  67.86 
 
 
244 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  46.43 
 
 
245 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  46.76 
 
 
262 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  47.65 
 
 
251 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  58.28 
 
 
172 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  52.94 
 
 
171 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  57.82 
 
 
183 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  50 
 
 
651 aa  165  8e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  44.44 
 
 
313 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  41.12 
 
 
197 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  41.12 
 
 
201 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  40.76 
 
 
201 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.79 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.79 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  33.33 
 
 
456 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.79 
 
 
481 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  39.2 
 
 
221 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  39.2 
 
 
221 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  38.64 
 
 
221 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  36.92 
 
 
221 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  38.64 
 
 
221 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  38.64 
 
 
221 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  38.64 
 
 
221 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.79 
 
 
481 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  38.64 
 
 
221 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  38.64 
 
 
221 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  36.18 
 
 
458 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
221 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  37.5 
 
 
216 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.49 
 
 
456 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.67 
 
 
491 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  29.54 
 
 
307 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.38 
 
 
491 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  31.71 
 
 
455 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  31.9 
 
 
455 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.56 
 
 
455 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.33 
 
 
477 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.49 
 
 
455 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.48 
 
 
455 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  32.45 
 
 
459 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.71 
 
 
455 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  32.23 
 
 
220 aa  99.8  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  31.74 
 
 
455 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.87 
 
 
491 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.47 
 
 
455 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  34.57 
 
 
197 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.47 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.94 
 
 
473 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.63 
 
 
471 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  30.43 
 
 
455 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  30.43 
 
 
455 aa  94  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.56 
 
 
486 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.74 
 
 
458 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  35.05 
 
 
445 aa  89.4  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  31.73 
 
 
285 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.88 
 
 
487 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.31 
 
 
491 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.33 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.58 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.33 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  32.78 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  36.13 
 
 
904 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  29.54 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03626  hypothetical protein  39.13 
 
 
427 aa  69.7  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.1 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0899  hypothetical protein  36.96 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002434  deacetylase DA1  36 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.13 
 
 
477 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  59.09 
 
 
277 aa  62.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  57.78 
 
 
271 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  39.18 
 
 
652 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  42.72 
 
 
1077 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  55.81 
 
 
551 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0564  polysaccharide deacetylase  32 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  26.67 
 
 
236 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  50.85 
 
 
790 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  45.37 
 
 
543 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  55.56 
 
 
561 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  55.38 
 
 
433 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  57.78 
 
 
492 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  50 
 
 
855 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  25.84 
 
 
390 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  25.85 
 
 
391 aa  52.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  51.56 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  44.12 
 
 
916 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  38.89 
 
 
483 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4228  hypothetical protein  50.77 
 
 
653 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  26.56 
 
 
483 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  53.97 
 
 
830 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  35.71 
 
 
2272 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  37.84 
 
 
484 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.29 
 
 
2179 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  50.82 
 
 
489 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  52 
 
 
521 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  48.75 
 
 
453 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  47.37 
 
 
846 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>