More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7854 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.3 
 
 
271 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.43 
 
 
192 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.15 
 
 
193 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.56 
 
 
237 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.79 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 
223 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  31.82 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.16 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.91 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  31.25 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.16 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  38.24 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.23 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.32 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.69 
 
 
281 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.17 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.43 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  30.68 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.85 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  73.91 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  28.65 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.65 
 
 
277 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.06 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  28.65 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.23 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  33.14 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  33.14 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  33.14 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  39.52 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.33 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.59 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.25 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  59.65 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.11 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  30.29 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  65.91 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.37 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.56 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.59 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.29 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  28.33 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.09 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.42 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.5 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.43 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  64.29 
 
 
551 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.51 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.14 
 
 
457 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.03 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.23 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.05 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.53 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.87 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  68.18 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  31.9 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.91 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.74 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.35 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  68.42 
 
 
1077 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.17 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  33.86 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  52.73 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  30.43 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.82 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.64 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  42.65 
 
 
652 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  57.78 
 
 
338 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.27 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  55.17 
 
 
904 aa  62.4  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  30.18 
 
 
190 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.65 
 
 
236 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2326  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  31.93 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  25.71 
 
 
313 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.55 
 
 
477 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  25.93 
 
 
297 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.39 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.26 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.42 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  54.55 
 
 
790 aa  59.7  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  26.24 
 
 
311 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  26.24 
 
 
311 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.93 
 
 
296 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  26.24 
 
 
311 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3850  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.77 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0622062  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  26 
 
 
310 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.75 
 
 
317 aa  58.9  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  30.67 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.41 
 
 
287 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  54.76 
 
 
561 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4890  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.14 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833858  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  32.74 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  25.14 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  54.55 
 
 
855 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  51.67 
 
 
484 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.17 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.12 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>