99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7382 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 266 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  63.68 
 
 		 309 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.01 
 
 		 233 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.06 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.47 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  38.22 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  48 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.08 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.66 
 
 		 245 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.13 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.46 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  33.46 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.76 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  35.98 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  38.76 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.45 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.95 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.05 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.21 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.31 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  37.63 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.35 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.45 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281874 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  34.64 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.47 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  34 
 
 		 376 aa  116  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.62 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.87 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.7 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.84 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  35.48 
 
 		 396 aa  92.8  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.18 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.79 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.46 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.4 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  30.09 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.11 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.13 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  41.05 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.63 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.51 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.54 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.94 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  32.14 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.29 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.92 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  35.56 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1309  hypothetical protein  37.9 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.983803 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  32.88 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.55 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.77 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.4 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  27.8 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.8 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.64 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.91 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.9 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  30.61 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.66 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35 
 
 		 191 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  27.4 
 
 		 297 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  31.61 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.93 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  30.2 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  31.33 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  27.89 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  32.35 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.69 
 
 		 242 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.95 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  33.33 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.35 
 
 		 301 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.62 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.63 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1270  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.41 
 
 		 234 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  26.92 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  30.41 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  26.24 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  29.14 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.76 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  26.35 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  30.2 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  29.33 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  30.2 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  30.2 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1895  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.14 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.949343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.1 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33 
 
 		 301 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.57 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0643  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.599844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  28.57 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  28.99 
 
 		 310 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  27.88 
 
 		 253 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>