196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5241 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.17 
 
 
309 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50 
 
 
233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  43.56 
 
 
252 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.78 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.08 
 
 
237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.26 
 
 
277 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.12 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.06 
 
 
288 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.07 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  40.93 
 
 
252 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.33 
 
 
256 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.61 
 
 
258 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.32 
 
 
245 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.99 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.57 
 
 
282 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.17 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.7 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.55 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.16 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.05 
 
 
281 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.07 
 
 
250 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
236 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  31.86 
 
 
277 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  31.86 
 
 
277 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.86 
 
 
277 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  38.21 
 
 
383 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.35 
 
 
250 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 
343 aa  96.7  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.24 
 
 
238 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  36.03 
 
 
396 aa  91.7  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  37.9 
 
 
377 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.62 
 
 
303 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.45 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  31.43 
 
 
318 aa  86.3  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.02 
 
 
192 aa  85.9  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.12 
 
 
313 aa  85.5  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.46 
 
 
304 aa  85.5  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.37 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.25 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  37.14 
 
 
190 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  31.25 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  47.47 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.2 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.58 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.4 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.71 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  39.52 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.03 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.02 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.96 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.32 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  40.2 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  32.39 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.86 
 
 
323 aa  68.9  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.86 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  32.19 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.24 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  36.79 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  28.89 
 
 
280 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  35.97 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  33.81 
 
 
290 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  30.48 
 
 
307 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  33.57 
 
 
311 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  31.87 
 
 
305 aa  59.3  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.25 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 
297 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.75 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.75 
 
 
307 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.67 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  34.04 
 
 
287 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  34.04 
 
 
287 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.5 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  34.04 
 
 
287 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2835  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  33.61 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204009  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  31.91 
 
 
287 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.03 
 
 
317 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  33.33 
 
 
300 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  30.86 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  28.42 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  31.21 
 
 
310 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  32.87 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.43 
 
 
312 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  35.79 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2387  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.98 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.581164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  35.71 
 
 
287 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  32.17 
 
 
317 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  32.17 
 
 
314 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.87 
 
 
301 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  34.48 
 
 
213 aa  52.4  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  29.67 
 
 
302 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4890  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  36.23 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833858  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  32.41 
 
 
314 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  32.17 
 
 
311 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  30.22 
 
 
302 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  32.17 
 
 
311 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  30.99 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>