134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1942 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.04 
 
 
288 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.04 
 
 
299 aa  231  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.75 
 
 
256 aa  229  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.09 
 
 
245 aa  226  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.82 
 
 
282 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.59 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  51.52 
 
 
252 aa  215  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.78 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.95 
 
 
288 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  50.24 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.09 
 
 
248 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.17 
 
 
233 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.36 
 
 
237 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.6 
 
 
309 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.78 
 
 
266 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  39.47 
 
 
377 aa  121  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  37.3 
 
 
383 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  44.51 
 
 
238 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.06 
 
 
244 aa  118  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.71 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.67 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.41 
 
 
277 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  35.64 
 
 
343 aa  108  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.36 
 
 
281 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 
318 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  30 
 
 
277 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30 
 
 
277 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.72 
 
 
258 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.81 
 
 
318 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  32.16 
 
 
376 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  33.88 
 
 
396 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.29 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.75 
 
 
311 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.33 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  33.48 
 
 
294 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.36 
 
 
192 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.65 
 
 
328 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.95 
 
 
319 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.94 
 
 
310 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.48 
 
 
303 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.38 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  33.63 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  33.78 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.78 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.57 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.33 
 
 
331 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.21 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.52 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  34.59 
 
 
277 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.02 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.12 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.51 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.41 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.73 
 
 
327 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  38 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.03 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.95 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.32 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  37.11 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  31.94 
 
 
190 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.29 
 
 
190 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.17 
 
 
191 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  34.48 
 
 
312 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.88 
 
 
234 aa  52  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13010  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.41 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  30.1 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  31.9 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  32.08 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.93 
 
 
247 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0643  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.25 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.599844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2186  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.33 
 
 
248 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  28.86 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  31.09 
 
 
190 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2326  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  31.84 
 
 
235 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  31.91 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  36.45 
 
 
307 aa  48.5  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  35.56 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  29.22 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  27.52 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  31.65 
 
 
313 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4652  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  30.83 
 
 
209 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17849  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  26.86 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2387  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.38 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.581164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7609  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.35 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  33.33 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.75 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1538  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  26.74 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0431142  normal  0.14512 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4209  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  27.88 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.57 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321116  normal  0.293575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1270  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1119  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00412306  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2775  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit(PcaH)  28.57 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000406236  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2693  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  30 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00265735  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2086  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  30.3 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  33.02 
 
 
304 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3889  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.32 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00117633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>