167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1587 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
299 aa  603  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  69.1 
 
 
288 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  67.96 
 
 
237 aa  288  8e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.82 
 
 
282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  47.04 
 
 
252 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.74 
 
 
256 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.97 
 
 
288 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.5 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.04 
 
 
234 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  52.44 
 
 
252 aa  230  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.77 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.67 
 
 
233 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.42 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.08 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  48.82 
 
 
238 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.93 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.14 
 
 
236 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  34.93 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  34.93 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.88 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.56 
 
 
237 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.95 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.98 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.65 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.71 
 
 
258 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  35.83 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.24 
 
 
238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.96 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
318 aa  109  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.45 
 
 
304 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.18 
 
 
303 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.23 
 
 
244 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  34.55 
 
 
377 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.94 
 
 
313 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.76 
 
 
311 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.49 
 
 
343 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  33.17 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  34.91 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.48 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.68 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  33.67 
 
 
349 aa  92.8  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  32.62 
 
 
376 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.49 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.38 
 
 
328 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  30.14 
 
 
396 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  31.46 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.7 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.75 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  33.16 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.16 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.1 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.72 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.51 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.85 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36 
 
 
220 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.8 
 
 
247 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  36.31 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  32.69 
 
 
190 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  29.34 
 
 
190 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.23 
 
 
191 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.61 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.44 
 
 
190 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.95 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.12 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 
292 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  36.28 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  36.28 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  32.12 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  32.12 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0627  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.17 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.799522  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  32.12 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  26.89 
 
 
224 aa  50.4  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  34.19 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  27.37 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0615  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.61 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  29.76 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  30.46 
 
 
283 aa  49.7  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4078  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.48 
 
 
300 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.22 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00387688  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1538  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.73 
 
 
235 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0431142  normal  0.14512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1382  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.22 
 
 
249 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.789862  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  27.4 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2501  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.78 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3854  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.58 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  28.57 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1859  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.96 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  29.01 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.78 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  30.56 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38260  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.14 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2387  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.96 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.581164  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  28.17 
 
 
314 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4172  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.42 
 
 
235 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3345  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.42 
 
 
235 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4419  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.42 
 
 
235 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>