269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2592 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.74 
 
 
192 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  45.71 
 
 
277 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.15 
 
 
271 aa  141  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.22 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.33 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  34.91 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.6 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.01 
 
 
233 aa  77  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.38 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.22 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.77 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.28 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.1 
 
 
234 aa  71.2  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.99 
 
 
247 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  32.24 
 
 
297 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  34.48 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  39.34 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  32.32 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.81 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.03 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.96 
 
 
220 aa  67.8  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1538  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.68 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0431142  normal  0.14512 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.51 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.92 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.67 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.85 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2050  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.53 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.500514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2693  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  31.98 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00265735  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.06 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  30.77 
 
 
308 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  23.16 
 
 
277 aa  64.7  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0645  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  37.4 
 
 
246 aa  64.7  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.88521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  23.16 
 
 
277 aa  64.7  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  23.16 
 
 
277 aa  64.7  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  30.43 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  27.68 
 
 
307 aa  64.7  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  30.26 
 
 
305 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  30.72 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3727  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  36.64 
 
 
246 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.7 
 
 
307 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  29.31 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  37.14 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  27.27 
 
 
306 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  28.73 
 
 
305 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  28.98 
 
 
307 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  29.45 
 
 
305 aa  62.8  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.75 
 
 
282 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.94 
 
 
249 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00387688  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  33.78 
 
 
287 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  33.78 
 
 
287 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.21 
 
 
307 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  24.06 
 
 
281 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.32 
 
 
295 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1382  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.34 
 
 
249 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.789862  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  33.78 
 
 
287 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1270  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  36.7 
 
 
234 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  30.77 
 
 
304 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2087  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.11 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.419752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1441  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta oxidoreductase protein  29.34 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.78 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.89 
 
 
256 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  32.41 
 
 
292 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3493  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.02 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364827  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.29 
 
 
266 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4651  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.43 
 
 
242 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.198093  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  31.91 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  27.32 
 
 
310 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.76 
 
 
317 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2688  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.09 
 
 
241 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.166838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4163  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.16 
 
 
238 aa  58.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  26.19 
 
 
213 aa  58.5  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.23 
 
 
288 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.12 
 
 
304 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5941  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.27 
 
 
249 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0409676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.8 
 
 
287 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2501  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.74 
 
 
242 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3477  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  37.61 
 
 
245 aa  57.8  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  27.42 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.33 
 
 
237 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0311  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.34 
 
 
246 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0780  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.86 
 
 
239 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.31 
 
 
288 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  28.8 
 
 
304 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  31.06 
 
 
317 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.64 
 
 
309 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  28.57 
 
 
302 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2387  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.99 
 
 
241 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.581164  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  31.06 
 
 
314 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4078  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  36.04 
 
 
300 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  27.07 
 
 
311 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  30 
 
 
311 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  31.87 
 
 
252 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0615  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.27 
 
 
255 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.4 
 
 
300 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1895  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.06 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.949343 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 
316 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1698  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.57 
 
 
395 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.57 
 
 
304 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 
316 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>