172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4772 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
309 aa  631  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  57.14 
 
 
266 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.02 
 
 
233 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.4 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.59 
 
 
256 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  42.27 
 
 
252 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  50.34 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.07 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.68 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.5 
 
 
237 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.42 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.97 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  41.83 
 
 
252 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.37 
 
 
282 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.81 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  31.76 
 
 
277 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.76 
 
 
277 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  31.76 
 
 
277 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.02 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.6 
 
 
234 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.92 
 
 
258 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.31 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.44 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  33.49 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.14 
 
 
244 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  33.04 
 
 
343 aa  119  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.1 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  35.71 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.16 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  32.09 
 
 
376 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.39 
 
 
250 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.72 
 
 
236 aa  106  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  32.11 
 
 
396 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 
318 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  35.81 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  29.84 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.29 
 
 
311 aa  85.9  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.57 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.68 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.57 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.44 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.34 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.74 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.36 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  32.84 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.49 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1309  hypothetical protein  40.34 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.983803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.87 
 
 
190 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.34 
 
 
192 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  30.99 
 
 
190 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  35.66 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.11 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.69 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.4 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  28.07 
 
 
190 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.26 
 
 
220 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.56 
 
 
216 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.898737  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.82 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.19 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  26.16 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.64 
 
 
193 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35 
 
 
191 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  26.8 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.61 
 
 
300 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  28.22 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  36.96 
 
 
242 aa  52.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.03 
 
 
297 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.82 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  31.08 
 
 
287 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1270  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.79 
 
 
234 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1581  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.29 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  25.17 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2086  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  30.16 
 
 
210 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507237  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  32.32 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  27.21 
 
 
283 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1824  twin-arginine translocation pathway signal  30.57 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0820429  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2775  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit(PcaH)  30.5 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000406236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  29.73 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  30.2 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  29.73 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  29.73 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.59 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1119  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  37.29 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00412306  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  29.73 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.88 
 
 
234 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321116  normal  0.293575 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2387  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.9 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.581164  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3889  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.88 
 
 
234 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.94 
 
 
301 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5085  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.45 
 
 
238 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02907  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  33.1 
 
 
187 aa  46.6  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2835  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  28.92 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204009  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4652  protocatechuate 3,4-dioxygenase, alpha subunit  31.25 
 
 
209 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17849  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.29 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4078  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.06 
 
 
300 aa  46.2  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  31.48 
 
 
307 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>