226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8639 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 297 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  79.12 
 
 		 297 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  79.46 
 
 		 297 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  73.56 
 
 		 296 aa  464  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  62.5 
 
 		 317 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  57.97 
 
 		 312 aa  348  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.28 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  46.6 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.94 
 
 		 312 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.96 
 
 		 288 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.65 
 
 		 287 aa  262  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.4 
 
 		 287 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  40.96 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  40.96 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.07 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  39.16 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  40.85 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.7 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  38.75 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.67 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.29 
 
 		 293 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  39.25 
 
 		 306 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  36.9 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.97 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.78 
 
 		 293 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.97 
 
 		 290 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.91 
 
 		 308 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.18 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  40.84 
 
 		 309 aa  195  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  39.21 
 
 		 289 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  39.3 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  38.11 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  38.91 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.19 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  36.3 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.8 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  38.11 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  40 
 
 		 296 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  38.22 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  35.2 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  40.23 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  38.76 
 
 		 334 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  38.03 
 
 		 296 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  38.32 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.65 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.4 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.67 
 
 		 287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  39.05 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  37.11 
 
 		 329 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  36.72 
 
 		 328 aa  175  8e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.33 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.22 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  31.8 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  30.8 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 275 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  31.95 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  29.76 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  32.5 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  29.79 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  30.66 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  29.79 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  31.95 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  30.66 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  30.66 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  30.66 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  30.66 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  31.12 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  29.55 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  30.55 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  29.86 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  33.75 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 300 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  31.51 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  33.75 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  33.75 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  30 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.49 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.92 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.33 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  31.47 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  32.5 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  32.79 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  33.2 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  30.56 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  30.89 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  30.56 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  30.83 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  31.41 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  29.88 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.96 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  29.05 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  32.63 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4270  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  31.98 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.760341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>