227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7639 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 
297 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  79.46 
 
 
297 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  74.07 
 
 
297 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  74.24 
 
 
296 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.81 
 
 
317 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  58.64 
 
 
312 aa  355  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.19 
 
 
300 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.46 
 
 
288 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.28 
 
 
312 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  46.26 
 
 
307 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.96 
 
 
287 aa  259  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  41.02 
 
 
279 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  39.39 
 
 
306 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  39.72 
 
 
293 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.67 
 
 
290 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.28 
 
 
294 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.86 
 
 
287 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.32 
 
 
290 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.36 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  37.97 
 
 
303 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  37.99 
 
 
301 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  37.67 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.06 
 
 
293 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.24 
 
 
309 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  36.51 
 
 
311 aa  193  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  38.64 
 
 
295 aa  193  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  39.45 
 
 
276 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.58 
 
 
300 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.78 
 
 
293 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.41 
 
 
301 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  41 
 
 
283 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.3 
 
 
308 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  37.28 
 
 
289 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  37.59 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  35.48 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  38.19 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.61 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.6 
 
 
287 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  37.68 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  37.37 
 
 
296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  38.41 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  39.31 
 
 
278 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  36.47 
 
 
328 aa  176  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  37.68 
 
 
290 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.55 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  37.21 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  36.55 
 
 
334 aa  172  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.64 
 
 
297 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.57 
 
 
287 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.36 
 
 
303 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  34.8 
 
 
329 aa  162  9e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.6 
 
 
304 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.21 
 
 
275 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  31.51 
 
 
305 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  33.47 
 
 
300 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  33.06 
 
 
300 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  33.06 
 
 
300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  31.95 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  28.57 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  33.06 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  31.69 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  31.62 
 
 
311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  33.61 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  33.61 
 
 
304 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  33.61 
 
 
304 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  33.61 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  33.61 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  33.61 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  33.61 
 
 
300 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  30.89 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  32.23 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  32.37 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  32.23 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  32.23 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 
300 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  31.67 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 
313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  31.54 
 
 
305 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.75 
 
 
307 aa  126  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  31.93 
 
 
308 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 
302 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  32.5 
 
 
302 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  30.08 
 
 
309 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 
307 aa  122  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  30.28 
 
 
310 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 
304 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  29.88 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  28.12 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  29.84 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.2 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.58 
 
 
308 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  29.72 
 
 
304 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  27.76 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4270  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  31.11 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.760341  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  30.35 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  28.19 
 
 
304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  31.4 
 
 
311 aa  113  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.73 
 
 
304 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.99 
 
 
298 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>