221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2116 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  74.67 
 
 		 304 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  73.53 
 
 		 307 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  73.86 
 
 		 307 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  55.4 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  53.61 
 
 		 300 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  50.33 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  52.74 
 
 		 310 aa  301  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  48.85 
 
 		 305 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  52.16 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  52.16 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  53.26 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  52.03 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  53.26 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  53.26 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  53.26 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  53.26 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  49.01 
 
 		 302 aa  291  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  51.17 
 
 		 300 aa  291  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  48.77 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  49.32 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  49.67 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  49.67 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  49.1 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  49.01 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  49.01 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  49.01 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  48.68 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  47.62 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.27 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  47.28 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  48.57 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  48.92 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  47.48 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  49.26 
 
 		 311 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  47.75 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  47.4 
 
 		 311 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  48.06 
 
 		 312 aa  265  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  47.86 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  43.96 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  48.14 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  47.73 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  51.25 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  49.83 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  47.74 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  49.14 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  46.81 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  45.55 
 
 		 311 aa  248  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  45.29 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  47.64 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  47.64 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  50 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  49.63 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  47.64 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  48.13 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  45.58 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.24 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.31 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  32.08 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.59 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.88 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.16 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.93 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  30.36 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.08 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  31.58 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.54 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  32.2 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  32.39 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.49 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  30.8 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.74 
 
 		 287 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  30 
 
 		 278 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.17 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.31 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  31.27 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.82 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.21 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  33.61 
 
 		 283 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.95 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  27.42 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  29.13 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.27 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.97 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.25 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.96 
 
 		 297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.95 
 
 		 296 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  33.47 
 
 		 260 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  31.06 
 
 		 287 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  33.19 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.94 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.93 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  30.64 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  30.64 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.8 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  29.45 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  28.38 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.3 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.31 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  29.5 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>