232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2152 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  97.35 
 
 		 302 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  81.67 
 
 		 300 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  80.79 
 
 		 300 aa  510  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  80.13 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  80.79 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  80.13 
 
 		 304 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  80.13 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  80.13 
 
 		 300 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  80.13 
 
 		 304 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  79.47 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  79.47 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  79.8 
 
 		 300 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  79.47 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  79.47 
 
 		 300 aa  502  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  77.48 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  77.48 
 
 		 300 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  78.67 
 
 		 300 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  68.44 
 
 		 305 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  66.11 
 
 		 305 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  65.02 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  64.17 
 
 		 307 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  62.54 
 
 		 307 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  60.14 
 
 		 313 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  59.09 
 
 		 307 aa  346  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  58.72 
 
 		 309 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  55.52 
 
 		 308 aa  345  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  57.86 
 
 		 311 aa  334  9e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  57.19 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  57.72 
 
 		 310 aa  332  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  56.19 
 
 		 311 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.29 
 
 		 304 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  61.99 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  59.35 
 
 		 301 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  61.62 
 
 		 310 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  52.45 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  57.86 
 
 		 304 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  54.07 
 
 		 311 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.29 
 
 		 307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.96 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  55.94 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  56.03 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  56.14 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  54.18 
 
 		 312 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.96 
 
 		 308 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  50.99 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  50.66 
 
 		 311 aa  299  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  56.55 
 
 		 304 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  53.14 
 
 		 316 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  53.14 
 
 		 316 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.01 
 
 		 304 aa  291  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  53.8 
 
 		 317 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  54.14 
 
 		 314 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  53.66 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  53 
 
 		 314 aa  278  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  52.45 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.2 
 
 		 298 aa  271  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.57 
 
 		 290 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  34.69 
 
 		 307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.57 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  34.29 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.59 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.4 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.69 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.82 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.7 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.46 
 
 		 295 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  35.27 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  33.07 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.86 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.02 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  34.33 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  34.01 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.82 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 287 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.96 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.4 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  32.62 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.75 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.34 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.18 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.66 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.51 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  29.79 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  30.22 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.62 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  32.46 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  29.2 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.97 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.52 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  30.17 
 
 		 306 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  28.62 
 
 		 253 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  33.47 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.58 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.62 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  27.62 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>