227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6473 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  100 
 
 		 253 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  64.14 
 
 		 260 aa  352  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  59.76 
 
 		 255 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  37.99 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  37.3 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  33.86 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  33.86 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  33.86 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  33.73 
 
 		 292 aa  141  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  35.18 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.88 
 
 		 290 aa  138  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  36.21 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.24 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  29.84 
 
 		 301 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.44 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  31.73 
 
 		 304 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.15 
 
 		 309 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.3 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.86 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.86 
 
 		 290 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.78 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  33.05 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  32.27 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.35 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.15 
 
 		 299 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  29.57 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.68 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  26.67 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  28.62 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  28.15 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  27.62 
 
 		 289 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  29.13 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  28.31 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  28.31 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  32.81 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.63 
 
 		 293 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  30.67 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.91 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  29.15 
 
 		 302 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  30.67 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  30.89 
 
 		 278 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  31.43 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  31.75 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.89 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  28.92 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.63 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  32.02 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  27.76 
 
 		 304 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.21 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  30.95 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.54 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  28.09 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.24 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  31.62 
 
 		 316 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.49 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  31.62 
 
 		 316 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  31.62 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  31.23 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  29.59 
 
 		 310 aa  111  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.74 
 
 		 308 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  30.38 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  30.95 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  29.17 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.08 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  28.19 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  28.09 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.98 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  29.11 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  29.54 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  29.66 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.99 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.52 
 
 		 287 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  28.74 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  28.69 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  28.74 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  28.74 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  26.98 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  29.55 
 
 		 300 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  30.77 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.24 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.51 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  27.92 
 
 		 304 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  29.32 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.95 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  28.74 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  32.19 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  29.55 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  28.05 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.08 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  28.52 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  28.74 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  28.52 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  28.52 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  28.52 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  28.52 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.68 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.51 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>