209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5310 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 289 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  68.99 
 
 		 287 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  66.67 
 
 		 293 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  65.49 
 
 		 301 aa  387  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  65.64 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  64.85 
 
 		 294 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  65.4 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  64.36 
 
 		 290 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  63.03 
 
 		 279 aa  362  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  61.32 
 
 		 276 aa  355  5e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  61.19 
 
 		 287 aa  349  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.98 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.52 
 
 		 287 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.65 
 
 		 297 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  48.75 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.94 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  45.8 
 
 		 306 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.69 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.18 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  46.5 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.5 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.25 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  48.86 
 
 		 278 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.4 
 
 		 290 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.14 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50 
 
 		 293 aa  248  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.45 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  44.19 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  43.11 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  51.68 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  44.52 
 
 		 329 aa  240  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.87 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  43.56 
 
 		 306 aa  238  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  43.01 
 
 		 303 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.64 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.37 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.56 
 
 		 309 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  41.79 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.65 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.58 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.19 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.61 
 
 		 287 aa  201  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.21 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.21 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.87 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  39.42 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  36.47 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  37.28 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.27 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  34.29 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.71 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  35.91 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.43 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  36.8 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  29.9 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.9 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.54 
 
 		 304 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  34.2 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  29 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  29.07 
 
 		 305 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  33.73 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  30.77 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  34.2 
 
 		 310 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  30.96 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  30.07 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  29.37 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  30.97 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  29.48 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  29.48 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  29.48 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  29.89 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  30.04 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  29.2 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  29.48 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  28.62 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  29.48 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  29.48 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  29.48 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  30.36 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  29.89 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  31.22 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.42 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.94 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  29.52 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  29.58 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.4 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  27.62 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  29.52 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.94 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  31.29 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  31.29 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  30.94 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>