244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4028 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 
300 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  81.67 
 
 
302 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  80.33 
 
 
302 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  75.67 
 
 
300 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  75.67 
 
 
304 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  75.67 
 
 
304 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  75.67 
 
 
300 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  75.59 
 
 
300 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  75.59 
 
 
300 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  75.59 
 
 
300 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  75.59 
 
 
300 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  75.33 
 
 
300 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  73.33 
 
 
300 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  73.33 
 
 
300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  73.33 
 
 
300 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  73.33 
 
 
300 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  73.33 
 
 
300 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  73.67 
 
 
300 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  63.12 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  64.12 
 
 
304 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  61.79 
 
 
305 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  57.14 
 
 
308 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  61.64 
 
 
307 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  60.66 
 
 
307 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  57.09 
 
 
310 aa  335  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  56.62 
 
 
307 aa  334  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  56.8 
 
 
313 aa  334  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  56.42 
 
 
309 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.63 
 
 
307 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.56 
 
 
304 aa  329  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  59.01 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  51.85 
 
 
311 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  53.57 
 
 
311 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  56.64 
 
 
310 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  51.18 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  49.17 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.61 
 
 
304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  55.94 
 
 
310 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  54.77 
 
 
311 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  54.77 
 
 
304 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  54.8 
 
 
312 aa  308  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  54.24 
 
 
301 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  53.33 
 
 
311 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.71 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  52.98 
 
 
311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  55.85 
 
 
304 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  53.9 
 
 
304 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  52.84 
 
 
304 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  53.71 
 
 
316 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  54.67 
 
 
317 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  53.71 
 
 
316 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  53.55 
 
 
304 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  53.31 
 
 
314 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  54.01 
 
 
311 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  53 
 
 
316 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  53.29 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.18 
 
 
298 aa  266  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.28 
 
 
290 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.92 
 
 
290 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.86 
 
 
309 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.62 
 
 
293 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.63 
 
 
296 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  36.73 
 
 
290 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  35.36 
 
 
296 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.32 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  33 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.88 
 
 
312 aa  145  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  35.77 
 
 
290 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  35.55 
 
 
297 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.71 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  34.36 
 
 
278 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.81 
 
 
309 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.53 
 
 
300 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.1 
 
 
287 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29 
 
 
296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  33.93 
 
 
276 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.06 
 
 
294 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.8 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.22 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.14 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  32.07 
 
 
306 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  31.51 
 
 
302 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.75 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.99 
 
 
306 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  31.25 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.99 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  30.89 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.87 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.74 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.52 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  34.3 
 
 
295 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.74 
 
 
299 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  31.23 
 
 
279 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.51 
 
 
297 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.14 
 
 
297 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.37 
 
 
255 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  36.6 
 
 
292 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.97 
 
 
289 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.56 
 
 
287 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.62 
 
 
287 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>