241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3378 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 290 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  98.62 
 
 		 290 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  91.72 
 
 		 309 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  82.07 
 
 		 293 aa  494  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  77.26 
 
 		 296 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  66.19 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  52.69 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.77 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.02 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  49.83 
 
 		 279 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  52.52 
 
 		 276 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  51.09 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.23 
 
 		 293 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  50.35 
 
 		 293 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.96 
 
 		 295 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.84 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.26 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  54.72 
 
 		 283 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  55.38 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.48 
 
 		 301 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  51.7 
 
 		 278 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  49.82 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  55.38 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.91 
 
 		 287 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  49.29 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  48.58 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.14 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  49.47 
 
 		 303 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.92 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.28 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  45.16 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  45.13 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.11 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  41.26 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.91 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.27 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  41.95 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.81 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.75 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  42.64 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.46 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  37.5 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  40.89 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.43 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  41.32 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.97 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.04 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.55 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  37.64 
 
 		 313 aa  189  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.08 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  35.56 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  36.16 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  34.81 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  34.07 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  34.81 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  34.81 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  34.44 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  34.07 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  33.92 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  33.91 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  34.19 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  33.57 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  35.06 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  34.8 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  33.45 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  33.8 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  33.8 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  34.69 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  32.45 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  35.83 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  34.3 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  33.67 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  33.46 
 
 		 287 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  32.96 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  32.52 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  32.36 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  32.52 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  33.71 
 
 		 311 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  31.5 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.09 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  32.52 
 
 		 304 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  33.46 
 
 		 304 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  31.43 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.57 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.21 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  31.62 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  32.96 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  30 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  30.86 
 
 		 260 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  31.62 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>