212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4340 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 		 287 aa  571  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  59.72 
 
 		 304 aa  333  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  57.24 
 
 		 297 aa  330  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  58.51 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  56.83 
 
 		 287 aa  318  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.9 
 
 		 293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.79 
 
 		 294 aa  311  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.4 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  54.01 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  55 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  54.12 
 
 		 301 aa  295  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.12 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  52.52 
 
 		 289 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  54.29 
 
 		 279 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.38 
 
 		 300 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  55.64 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  51.25 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.2 
 
 		 306 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.6 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  49.65 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 		 301 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  50.99 
 
 		 283 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  49.12 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 		 293 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  50.36 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  49.09 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 		 290 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.94 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.62 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  45.74 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  43.97 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.07 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  42.76 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  41.85 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  51 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  40.97 
 
 		 307 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.26 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.76 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.46 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.18 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.29 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.64 
 
 		 287 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.97 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.55 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.24 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  40.6 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  34.28 
 
 		 311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.21 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  36.59 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  35.64 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  37.07 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.85 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  37.77 
 
 		 283 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  33.22 
 
 		 313 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  31.87 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  36.36 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  33.56 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.63 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0961  catechol dioxygenase domain protein  47.18 
 
 		 167 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.378182 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  34.83 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  31.18 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  32.21 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  30.14 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  34.73 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  33.73 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.84 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  32.6 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  32.6 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  32.6 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  32.23 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  32.23 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.96 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  30.47 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.94 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  33.86 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  32.12 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  32.86 
 
 		 302 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  32.95 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  32.95 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  32.23 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.76 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  31.82 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  32 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  34.26 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  34.26 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  34.26 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  34.26 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  30.31 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  29.55 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  32.22 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  30.6 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  32.52 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.21 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>