82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0961 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0961  catechol dioxygenase domain protein  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.378182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.62 
 
 		 294 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.67 
 
 		 287 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  46.62 
 
 		 279 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  46.26 
 
 		 290 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  45.58 
 
 		 287 aa  122  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.58 
 
 		 293 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.18 
 
 		 287 aa  121  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.15 
 
 		 309 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.22 
 
 		 300 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.9 
 
 		 308 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  44.22 
 
 		 301 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.78 
 
 		 303 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  41.67 
 
 		 283 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.66 
 
 		 304 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  41.89 
 
 		 276 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  43.24 
 
 		 293 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  43.92 
 
 		 289 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  41.5 
 
 		 306 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.83 
 
 		 299 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.82 
 
 		 301 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  42.57 
 
 		 278 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  44.09 
 
 		 295 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.85 
 
 		 297 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.75 
 
 		 312 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.82 
 
 		 301 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  39.86 
 
 		 302 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  39.46 
 
 		 329 aa  102  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.14 
 
 		 290 aa  101  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.26 
 
 		 290 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  43.57 
 
 		 296 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.41 
 
 		 297 aa  97.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  37.16 
 
 		 303 aa  97.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.26 
 
 		 293 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.16 
 
 		 312 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.04 
 
 		 287 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.86 
 
 		 309 aa  95.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.67 
 
 		 287 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.73 
 
 		 300 aa  94.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  38.62 
 
 		 297 aa  94.4  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  33.33 
 
 		 311 aa  92  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  35.86 
 
 		 328 aa  89.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 		 334 aa  89  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  36.43 
 
 		 307 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.13 
 
 		 306 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  40.82 
 
 		 296 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.33 
 
 		 297 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.42 
 
 		 288 aa  84  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.66 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.64 
 
 		 317 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  38.97 
 
 		 313 aa  77.8  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  30.88 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  29.85 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  27.01 
 
 		 311 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  30.06 
 
 		 313 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  27.01 
 
 		 311 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  27.01 
 
 		 311 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  28.99 
 
 		 301 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  30.95 
 
 		 287 aa  51.2  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  24.19 
 
 		 290 aa  50.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  28.47 
 
 		 305 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  29.49 
 
 		 309 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  26.57 
 
 		 307 aa  47.8  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.65 
 
 		 275 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  24.41 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 304 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  25.49 
 
 		 308 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  25.78 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  26.49 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  24.82 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  29.2 
 
 		 310 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  25.35 
 
 		 304 aa  42  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  25.98 
 
 		 260 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  23.23 
 
 		 300 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  23.23 
 
 		 300 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  26.81 
 
 		 310 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  23.23 
 
 		 300 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  24.16 
 
 		 300 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  23.87 
 
 		 300 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  23.87 
 
 		 300 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  24.81 
 
 		 308 aa  40.8  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  22.22 
 
 		 304 aa  40.8  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>