205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6466 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 
255 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  59.76 
 
 
253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  61.6 
 
 
260 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  39.32 
 
 
287 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  36.14 
 
 
297 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  35.46 
 
 
292 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  35.86 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  34.14 
 
 
287 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  33.47 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  34.14 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  34.14 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  36.8 
 
 
289 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.19 
 
 
275 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  34.8 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  32.41 
 
 
276 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.91 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.34 
 
 
293 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  33.6 
 
 
310 aa  135  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.19 
 
 
287 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  31.91 
 
 
278 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  35.93 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  29.74 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  32.17 
 
 
301 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  34.33 
 
 
302 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.45 
 
 
287 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.34 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  31.78 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.65 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  31.37 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  30.6 
 
 
328 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  34.19 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  30.31 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  33.48 
 
 
302 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  29.78 
 
 
293 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  35.32 
 
 
316 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  35.32 
 
 
316 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.04 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  34.98 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.22 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.33 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  33.05 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.63 
 
 
307 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.06 
 
 
298 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  33.83 
 
 
311 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 
311 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.54 
 
 
295 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  32.37 
 
 
300 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.63 
 
 
307 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  29.81 
 
 
307 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  32.91 
 
 
311 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  34.57 
 
 
317 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  32.62 
 
 
309 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  32.47 
 
 
299 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  34.69 
 
 
311 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.22 
 
 
293 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  32.19 
 
 
310 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  33.33 
 
 
300 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  34.94 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  33.48 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  33.48 
 
 
300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  33.83 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.63 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  33.83 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  32.64 
 
 
300 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  32.64 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  32.64 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  33.48 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.7 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  31.76 
 
 
310 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 
304 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  30.71 
 
 
304 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.9 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.77 
 
 
296 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  30.47 
 
 
283 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  32.07 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.84 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  28.15 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  30.57 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.29 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  33.74 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.03 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.24 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  32.03 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  30.45 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  28.94 
 
 
305 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  29.49 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.82 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  29.39 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.43 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  31.92 
 
 
312 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.31 
 
 
297 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.94 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>