219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4137 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 301 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  66.89 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  69.58 
 
 		 290 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  68.49 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  65.86 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  67.24 
 
 		 308 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  67.61 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  65.38 
 
 		 289 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  65.96 
 
 		 279 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  59.65 
 
 		 276 aa  351  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  59.44 
 
 		 287 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.51 
 
 		 300 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  54.09 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  50.18 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.47 
 
 		 304 aa  275  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.65 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  47.14 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.75 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  45.08 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.89 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.33 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.95 
 
 		 301 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.45 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.1 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.44 
 
 		 293 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.45 
 
 		 309 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  45.45 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.86 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.58 
 
 		 290 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.23 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.72 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  44.72 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  43.05 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  48.96 
 
 		 296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.1 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  45.88 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  44.92 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  42.41 
 
 		 307 aa  237  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.52 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.39 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.31 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.51 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.07 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.14 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  37.2 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.23 
 
 		 287 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.77 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  37.02 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.73 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  36.53 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  36.4 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  36.25 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.03 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  31.78 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  32.48 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  31.73 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6466  chlorocatechol 1,2-dioxygenase  32.71 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  32.96 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  31.31 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.09 
 
 		 304 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  30.18 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  30.28 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  30.25 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  30.43 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  29.52 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  30.58 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  31.77 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  32.22 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.41 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  32.64 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  33.46 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  30.94 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  33.09 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  33.09 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  31.58 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  32.29 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.32 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  32.25 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  32.25 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  28.03 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  29.63 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  32.1 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  29.47 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0961  catechol dioxygenase domain protein  44.22 
 
 		 167 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.378182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  28.15 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  30 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  29.37 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  30.15 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  29.26 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1358  catechol 1,2-dioxygenase  30.4 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206234  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.78 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  31.71 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.94 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  29.11 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  26.37 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  28.78 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  27.43 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  26.64 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  26.6 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>