236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4881 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 307 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  85.02 
 
 		 307 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  63.4 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  61.81 
 
 		 307 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  62.54 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  61.89 
 
 		 304 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  62.87 
 
 		 302 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  61.44 
 
 		 305 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  60.66 
 
 		 300 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  61.24 
 
 		 300 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  60.26 
 
 		 300 aa  363  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  60.26 
 
 		 304 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  60.26 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  60.26 
 
 		 304 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  60.59 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  60.59 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  60.59 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  59.93 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  59.93 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  59.93 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  59.93 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  58.96 
 
 		 300 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  58.63 
 
 		 300 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  58.36 
 
 		 300 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  59.15 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  55.41 
 
 		 311 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  55.08 
 
 		 311 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  54.75 
 
 		 311 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  58.18 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  55.12 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  57.75 
 
 		 313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  53.75 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  53.2 
 
 		 304 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  59.84 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  56.69 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  52.68 
 
 		 304 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  52.33 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  52.67 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  57.84 
 
 		 311 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  59.57 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  56.57 
 
 		 310 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.85 
 
 		 307 aa  299  5e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  52.61 
 
 		 301 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  51.52 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  54.01 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1363  catechol 1,2-dioxygenase  53.31 
 
 		 311 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  0.0619689 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1307  catechol 1,2-dioxygenase  55.4 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6523  catechol 1,2-dioxygenase  55.4 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  48.17 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6130  catechol 1,2-dioxygenase  54.36 
 
 		 316 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7045  catechol 1,2-dioxygenase  55.05 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.73 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  54.23 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6585  catechol 1,2-dioxygenase  53.66 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  47.8 
 
 		 304 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6300  catechol 1,2-dioxygenase  53.15 
 
 		 317 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636694 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3830  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.43 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  34.46 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.27 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.71 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.86 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.88 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  32.18 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.56 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  35.35 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.13 
 
 		 275 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.88 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  35.17 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.57 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.49 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.36 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  32.36 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  31.4 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  33.46 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.75 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  36.86 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.77 
 
 		 290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.68 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.16 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.98 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.16 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.94 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.69 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  36.19 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  38.67 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  33.59 
 
 		 278 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  32.92 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  31.4 
 
 		 276 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  39.44 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  31.58 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.26 
 
 		 287 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.03 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  39.63 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.4 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  39.55 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  29.67 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  29.45 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.32 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.187474 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  29.67 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>